37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1586 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1586  TonB family protein  100 
 
 		 276 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0587  TonB family protein  29.94 
 
 		 324 aa  94.7  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3631  TonB-like  28.3 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.653756  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2362  protein TolA  36.47 
 
 		 342 aa  65.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.288809 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2361  TonB family protein  35.71 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.264132 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0204  TonB family protein  26.47 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000615239  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1636  TonB-like  29.35 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.484992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2211  TonB family protein  27.12 
 
 		 274 aa  53.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000585223  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1852  TonB-like protein  31.54 
 
 		 366 aa  51.6  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1700  TonB family protein  33.33 
 
 		 342 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00909883  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2976  putative TonB transport protein  26.76 
 
 		 289 aa  50.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0535  protein TolA  32.97 
 
 		 345 aa  49.7  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000935471  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0754  TonB family protein  29 
 
 		 317 aa  49.7  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0897  hypothetical protein  31.63 
 
 		 341 aa  49.7  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812436  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3324  TonB family protein  26.92 
 
 		 258 aa  48.9  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0714054  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2530  LytB protein  29.92 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000152154  normal  0.947452 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0468  TonB family protein  30.68 
 
 		 420 aa  47.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.662899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1712  hypothetical protein  28.44 
 
 		 280 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0852036  hitchhiker  0.00264543 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0280  TonB domain-containing protein  37.97 
 
 		 341 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.256703  hitchhiker  0.000121849 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0026  TonB-dependent receptor, putative  24.48 
 
 		 226 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.429014  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0695  TonB family protein  36.67 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.773203  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0660  TonB-like protein  36.67 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2275  TonB family protein  34.04 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1922  TonB family protein  34.04 
 
 		 208 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0694  TonB family protein  36.67 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335594  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2225  TonB family protein  44.68 
 
 		 351 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  hitchhiker  0.000359894 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  26.09 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  23.97 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2461  protein TolA  46.51 
 
 		 380 aa  43.9  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.216675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  26.04 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  36.92 
 
 		 266 aa  43.5  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0704  TonB family protein  26.2 
 
 		 253 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.149916  normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0691  putative periplasmic protein  22.42 
 
 		 288 aa  43.1  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00126831  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3471  TonB family protein  27.86 
 
 		 245 aa  42.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0644109  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3323  protein TolA  34.62 
 
 		 306 aa  42.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.554082  normal  0.672074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7000  hypothetical protein  31.33 
 
 		 154 aa  42.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695854 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3202  TolA protein  31.71 
 
 		 341 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>