13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1067 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1067  TolA protein  100 
 
 
346 aa  704    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.251769  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0948  protein TolA  97.4 
 
 
346 aa  686    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.929529  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01563  protein TolA  52.11 
 
 
322 aa  260  3e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.479302  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3120  protein TolA  48.75 
 
 
351 aa  240  2.9999999999999997e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0897  hypothetical protein  23.97 
 
 
341 aa  70.9  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812436  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0535  protein TolA  37.08 
 
 
345 aa  63.9  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000935471  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2230  TonB family protein  37.5 
 
 
308 aa  57.4  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2530  LytB protein  34.78 
 
 
253 aa  52.8  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000152154  normal  0.947452 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0783  protein TolA  37.08 
 
 
320 aa  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  28.2 
 
 
271 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2216  TonB domain-containing protein  34.09 
 
 
316 aa  46.2  0.0009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  25.29 
 
 
273 aa  45.1  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49618  predicted protein  31.88 
 
 
958 aa  43.5  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>