68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2216 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_2216  TonB domain-containing protein  100 
 
 
316 aa  568  1e-161  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0243  TonB family protein  44.64 
 
 
333 aa  90.9  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  33 
 
 
484 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  47.66 
 
 
489 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  50 
 
 
926 aa  80.1  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  64.21 
 
 
268 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  31.28 
 
 
444 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  40.43 
 
 
630 aa  74.7  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  48.96 
 
 
423 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1228  TolA protein, putative  35.25 
 
 
467 aa  65.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.382434  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0144  TonB-like  39.01 
 
 
318 aa  65.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1988  group-specific protein  27.38 
 
 
928 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  39.29 
 
 
1261 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  28.57 
 
 
407 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1586  TonB family protein  26.38 
 
 
276 aa  61.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  41.94 
 
 
344 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  31.25 
 
 
897 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  34.18 
 
 
332 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0535  protein TolA  36.67 
 
 
345 aa  58.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000935471  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  34.18 
 
 
332 aa  56.6  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23491  hypothetical protein  45.45 
 
 
480 aa  55.8  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.425384 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2230  TonB family protein  45.33 
 
 
308 aa  55.8  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  45.63 
 
 
2313 aa  55.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  34.21 
 
 
522 aa  52.8  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1852  TonB-like protein  33.09 
 
 
366 aa  52.4  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1573  hypothetical protein  33.33 
 
 
1197 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.275879  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.57 
 
 
257 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2530  LytB protein  36 
 
 
253 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000152154  normal  0.947452 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  29.47 
 
 
830 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.57 
 
 
261 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  36.08 
 
 
453 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3858  rhs element Vgr protein  44.71 
 
 
258 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1700  TonB family protein  29.75 
 
 
342 aa  50.8  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00909883  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  29.08 
 
 
273 aa  50.1  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1469  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.67 
 
 
445 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0854841  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0549  hypothetical protein  39.81 
 
 
501 aa  48.9  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  50.52 
 
 
3471 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  28.42 
 
 
991 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0436  hypothetical protein  52.63 
 
 
613 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1296  peptidase S11 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase 1  39.13 
 
 
550 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.354374  normal  0.606221 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  50.52 
 
 
3472 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  50.52 
 
 
3521 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0783  protein TolA  34.33 
 
 
320 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0449  hypothetical protein  54.39 
 
 
611 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00263959  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  56.6 
 
 
539 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0459  hypothetical protein  54.39 
 
 
611 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0872017  normal  0.526818 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0897  hypothetical protein  31.16 
 
 
341 aa  47  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812436  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0678  TolA family protein  38.24 
 
 
355 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.805886  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0695  protein TolA  38.24 
 
 
355 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337402  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0587  TonB family protein  32.35 
 
 
324 aa  46.2  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22510  hypothetical protein  35.9 
 
 
608 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.818778 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2940  hypothetical protein  25.83 
 
 
298 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000421874  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0746  TonB family protein  23.11 
 
 
316 aa  45.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000019388  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  25.35 
 
 
671 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  40 
 
 
687 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8424  protein of unknown function DUF470  35.62 
 
 
701 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  41.89 
 
 
332 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  33.7 
 
 
271 aa  44.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3298  flagellar hook-length control protein  27.27 
 
 
602 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2193  Tol-Pal system TolA  22.98 
 
 
318 aa  43.9  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00964226  normal  0.375599 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1913  hypothetical protein  22.68 
 
 
1198 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0476202  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2374  glycosy hydrolase family protein  37.78 
 
 
535 aa  43.9  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3324  TonB family protein  28.92 
 
 
258 aa  43.5  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0714054  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0359  DNA repair protein  32.98 
 
 
776 aa  43.5  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.896103 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0304  protein TolA  34.43 
 
 
275 aa  43.1  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.28757  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1434  hypothetical protein  31.51 
 
 
772 aa  43.1  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.709183  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4621  hypothetical protein  38.81 
 
 
481 aa  42.7  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.957856  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2366  hypothetical protein  25.86 
 
 
382 aa  42.7  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.18293 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>