14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6458 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6458  hypothetical protein  100 
 
 		 9529 aa  19070    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4829  hypothetical protein  46.52 
 
 		 5185 aa  249  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27186 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1806  hypothetical protein  42.86 
 
 		 275 aa  144  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6461  hypothetical protein  48.28 
 
 		 1368 aa  117  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0936  hypothetical protein  31.49 
 
 		 3677 aa  104  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1435  hypothetical protein  41.91 
 
 		 3437 aa  104  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0503508 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1946  hypothetical protein  32.64 
 
 		 491 aa  82  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1262  hypothetical protein  32.58 
 
 		 533 aa  54.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0451  hypothetical protein  31.43 
 
 		 682 aa  53.9  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.935118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  27.33 
 
 		 334 aa  53.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  23.31 
 
 		 1240 aa  51.6  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  25.68 
 
 		 331 aa  49.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2438  Serine/threonine protein kinase-like protein  32.29 
 
 		 620 aa  48.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00115665 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3329  hypothetical protein  40.91 
 
 		 624 aa  48.1  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>