68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2230 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2230  TonB family protein  100 
 
 		 308 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0897  hypothetical protein  34.84 
 
 		 341 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812436  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1856  TolA family protein  27.35 
 
 		 319 aa  90.9  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0299684  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2940  hypothetical protein  32.17 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000421874  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2565  Tol-Pal system TolA  28.18 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000197392  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0948  protein TolA  28.62 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.929529  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1067  TolA protein  28.52 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.251769  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1393  hypothetical protein  29.97 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536616  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  42.93 
 
 		 925 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  26.87 
 
 		 271 aa  79  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3120  protein TolA  33.95 
 
 		 351 aa  79  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  28.14 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1730  putative tolA protein  27.94 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1606  TolA family protein  27.33 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000895247  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0144  TonB-like  30.18 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1461  TolA family protein  27.02 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00341972  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  30.66 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  30.66 
 
 		 332 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02685  TolA-like protein  28.72 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00715679  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0535  protein TolA  41.46 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000935471  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0565  protein TolA  38.46 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.370108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0469  TonB family protein  32.02 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01563  protein TolA  31.23 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.479302  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2087  hypothetical protein  33.33 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1700  TonB family protein  31.79 
 
 		 342 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00909883  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1526  TolA family protein  32.65 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124316  normal  0.623667 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0783  protein TolA  33.09 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4054  TonB, C-terminal  35.71 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2216  TonB domain-containing protein  42.68 
 
 		 316 aa  55.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1784  protein TolA  27.88 
 
 		 341 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000349437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1745  TolA family protein  27.88 
 
 		 342 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000294178  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2539  protein TolA  27.88 
 
 		 340 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102859  hitchhiker  0.00000353705 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1741  Tol-Pal system TolA  27.88 
 
 		 340 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057982  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49618  predicted protein  39.68 
 
 		 958 aa  53.9  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2530  LytB protein  30.58 
 
 		 253 aa  53.1  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000152154  normal  0.947452 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0288  peptidase M56 BlaR1  39.69 
 
 		 651 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2193  Tol-Pal system TolA  26.06 
 
 		 318 aa  50.4  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00964226  normal  0.375599 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  29.13 
 
 		 331 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  32.22 
 
 		 725 aa  50.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  25.27 
 
 		 3242 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3088  TonB family protein  70.69 
 
 		 528 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0726849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3033  TonB family protein  70.69 
 
 		 528 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0816  hypothetical protein  62.5 
 
 		 373 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00128516  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1897  TolA protein, membrane component  22.35 
 
 		 335 aa  49.3  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18871  predicted protein  27.31 
 
 		 1682 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00445245  hitchhiker  0.0000013419 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2732  protein TolA  28.94 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00666488  hitchhiker  0.0000225144 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  27.75 
 
 		 2196 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43680  predicted protein  41.44 
 
 		 1458 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.16765  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2207  putative TonB protein  34.52 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259099 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2532  TolA family protein  27.11 
 
 		 340 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000043804  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2441  TolA family protein  27.11 
 
 		 340 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000397376  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2369  TolA family protein  27.11 
 
 		 340 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000264795  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1430  tolA protein  27 
 
 		 356 aa  46.6  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000458161  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1228  TolA protein, putative  29.37 
 
 		 467 aa  46.2  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.382434  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1632  hypothetical protein  50.54 
 
 		 846 aa  45.4  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.790758 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  43.86 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  28.57 
 
 		 2906 aa  44.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2749  tolA protein  27.88 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2215  hypothetical protein  40.71 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0304  protein TolA  40 
 
 		 275 aa  44.3  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.28757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  30.36 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4972  S-layer-like domain-containing protein  35.63 
 
 		 939 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2225  TonB family protein  31.29 
 
 		 351 aa  43.5  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  hitchhiker  0.000359894 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2149  hypothetical protein  41.75 
 
 		 333 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3631  TonB-like  38.18 
 
 		 332 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.653756  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2000  hypothetical protein  41.75 
 
 		 333 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1195  hypothetical protein  34.12 
 
 		 289 aa  42.7  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0720  hypothetical protein  56.14 
 
 		 359 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>