51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3631 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3631  TonB-like  100 
 
 		 332 aa  649    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.653756  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0280  TonB domain-containing protein  30.67 
 
 		 341 aa  113  5e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.256703  hitchhiker  0.000121849 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1586  TonB family protein  29.13 
 
 		 276 aa  101  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2362  protein TolA  48.35 
 
 		 342 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.288809 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0587  TonB family protein  31.23 
 
 		 324 aa  98.6  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2361  TonB family protein  43.68 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.264132 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  42.05 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  39.77 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3890  TonB/TolA-like protein  39.02 
 
 		 351 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0754  TonB family protein  27.53 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0678  TolA family protein  42.65 
 
 		 355 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.805886  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0695  protein TolA  42.65 
 
 		 355 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0318  TonB-like  37.8 
 
 		 351 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.782104  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0801  TonB family protein  37.8 
 
 		 351 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0770  protein TolA  37.8 
 
 		 351 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0734059  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1221  biopolymer transport protein TolA  33.33 
 
 		 372 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.882269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1700  TonB family protein  35.71 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00909883  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2586  protein TolA  34.55 
 
 		 350 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.807612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2628  putative signal peptide protein  26.1 
 
 		 356 aa  50.4  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0279  TonB family protein  30.95 
 
 		 221 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.219995  unclonable  0.00000796861 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2530  LytB protein  35 
 
 		 253 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000152154  normal  0.947452 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0860  protein TolA  37.17 
 
 		 323 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000165303  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1852  TonB-like protein  28 
 
 		 366 aa  48.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3994  protein TolA  32.35 
 
 		 358 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.513554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  26.43 
 
 		 324 aa  47.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0469  TonB family protein  24.12 
 
 		 335 aa  46.2  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3202  TolA protein  32.93 
 
 		 341 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3240  TolA protein  32.93 
 
 		 341 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137391  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0704  TonB family protein  31.93 
 
 		 253 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.149916  normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2080  hypothetical protein  32.93 
 
 		 341 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1948  TolA protein  32.93 
 
 		 341 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2662  TolA protein  32.93 
 
 		 341 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0828  TolA protein  32.93 
 
 		 341 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3255  TolA-related transport transmembrane protein  32.93 
 
 		 341 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1374  TolA protein superfamily  32.93 
 
 		 334 aa  45.8  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  37.89 
 
 		 271 aa  45.8  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  37.89 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0695  TonB family protein  29.37 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.773203  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0694  TonB family protein  29.37 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335594  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4403  TonB-like  31.37 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0296  TonB family protein  40 
 
 		 192 aa  45.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.501674  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1276  TonB family protein  36.25 
 
 		 326 aa  44.3  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274487  normal  0.431648 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0261  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  27.6 
 
 		 351 aa  44.7  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00647443  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0683  protein TolA  30.83 
 
 		 342 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.730086 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2230  TonB family protein  33.33 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51730  TolA protein  31.25 
 
 		 347 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000424658  decreased coverage  0.00000451 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2211  TonB family protein  27.43 
 
 		 274 aa  43.5  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000585223  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0727  protein TolA  33.68 
 
 		 342 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00429068  normal  0.0892562 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  28 
 
 		 244 aa  43.1  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4537  TolA protein  31.25 
 
 		 345 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1331  hypothetical protein  40.98 
 
 		 247 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>