37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0754 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0754  TonB family protein  100 
 
 		 317 aa  635    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0749  transcriptional regulator, Fis family  26.63 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0027337  normal  0.178173 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  27.49 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2211  TonB family protein  36.92 
 
 		 274 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000585223  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1699  TonB-dependent receptor, putative  28.26 
 
 		 237 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1712  hypothetical protein  26.04 
 
 		 280 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0852036  hitchhiker  0.00264543 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1636  TonB-like  26.76 
 
 		 235 aa  50.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.484992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2072  hypothetical protein  32.95 
 
 		 246 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2906  TonB-like  40.98 
 
 		 235 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155829  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  40.38 
 
 		 237 aa  48.9  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1586  TonB family protein  30.34 
 
 		 276 aa  48.9  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0204  TonB family protein  26.01 
 
 		 245 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000615239  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  24.22 
 
 		 324 aa  47.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0746  TonB family protein  22.39 
 
 		 316 aa  47.4  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000019388  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  23.39 
 
 		 292 aa  46.6  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  37.78 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  37.1 
 
 		 298 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  37.1 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0587  TonB family protein  28.89 
 
 		 324 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  24.42 
 
 		 290 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  37.1 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3631  TonB-like  28.12 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.653756  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0593  TonB-like protein  24.51 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2362  protein TolA  30.99 
 
 		 342 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.288809 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0704  TonB family protein  30.85 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.149916  normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3512  TonB family protein  36.94 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00623688  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  32.91 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  33.78 
 
 		 246 aa  43.9  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2361  TonB family protein  31.82 
 
 		 163 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.264132 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0510  TonB family protein  28.29 
 
 		 250 aa  43.1  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0243  TonB family protein  37.31 
 
 		 333 aa  43.1  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0683  protein TolA  31.93 
 
 		 342 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.730086 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3402  hypothetical protein  26.97 
 
 		 431 aa  42.7  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2530  LytB protein  27.96 
 
 		 253 aa  42.7  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000152154  normal  0.947452 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1027  TonB, C-terminal  33.33 
 
 		 235 aa  42.7  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3581  TonB family protein  32.02 
 
 		 253 aa  42.4  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0486  TonB, C-terminal  44.19 
 
 		 300 aa  42.4  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.544308  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>