15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1712 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1712  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  559  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0852036  hitchhiker  0.00264543 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0749  transcriptional regulator, Fis family  44.14 
 
 		 285 aa  194  9e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0027337  normal  0.178173 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2162  transcriptional regulator, Fis family  31.68 
 
 		 298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.111868  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0858  Fis family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.487763  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0746  TonB family protein  25.75 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000019388  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1909  hypothetical protein  26.56 
 
 		 314 aa  95.5  9e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0613  TonB-like  38.14 
 
 		 286 aa  68.9  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.543734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2211  TonB family protein  26.33 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000585223  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3324  TonB family protein  24.64 
 
 		 258 aa  52.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0714054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0204  TonB family protein  25.66 
 
 		 245 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000615239  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0754  TonB family protein  27.05 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3636  hypothetical protein  24.03 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1586  TonB family protein  29.79 
 
 		 276 aa  45.8  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3539  TonB-like  26.09 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  8.08035e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  36.14 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>