32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2362 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2362  protein TolA  100 
 
 		 342 aa  663    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.288809 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0280  TonB domain-containing protein  54.13 
 
 		 341 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.256703  hitchhiker  0.000121849 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2361  TonB family protein  70 
 
 		 163 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.264132 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0860  protein TolA  40.16 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000165303  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3631  TonB-like  40.35 
 
 		 332 aa  106  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.653756  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1586  TonB family protein  30.32 
 
 		 276 aa  96.7  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0587  TonB family protein  29.57 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0279  TonB family protein  36.9 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.219995  unclonable  0.00000796861 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  60.71 
 
 		 1261 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  46.46 
 
 		 489 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  28.39 
 
 		 2449 aa  58.9  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  56.25 
 
 		 926 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  56.67 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  34.17 
 
 		 522 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  56.9 
 
 		 484 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  46.99 
 
 		 423 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  47.95 
 
 		 332 aa  49.7  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  48.65 
 
 		 630 aa  48.9  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0754  TonB family protein  27.91 
 
 		 317 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0704  TonB family protein  28.47 
 
 		 253 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.149916  normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 333 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1909  hypothetical protein  27.84 
 
 		 314 aa  47.8  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0525  hypothetical protein  64.86 
 
 		 334 aa  47.4  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0858  Fis family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.487763  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2211  TonB family protein  30.99 
 
 		 274 aa  44.3  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000585223  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2976  putative TonB transport protein  31.4 
 
 		 289 aa  44.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0694  TonB family protein  28.17 
 
 		 256 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335594  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0695  TonB family protein  28.17 
 
 		 256 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.773203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1988  group-specific protein  31.43 
 
 		 928 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1631  sporulation domain-containing protein  33.64 
 
 		 525 aa  43.1  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0746  TonB family protein  27.95 
 
 		 316 aa  42.7  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000019388  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  46.15 
 
 		 539 aa  42.7  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>