12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0204 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0204  TonB family protein  100 
 
 		 245 aa  499  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000615239  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3539  TonB-like  53.28 
 
 		 251 aa  225  4e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  8.08035e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0026  TonB-dependent receptor, putative  52.61 
 
 		 226 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.429014  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3324  TonB family protein  42.62 
 
 		 258 aa  185  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0714054  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3471  TonB family protein  46.5 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0644109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3581  TonB family protein  45.34 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3512  TonB family protein  43.5 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00623688  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2976  putative TonB transport protein  25.37 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1586  TonB family protein  23.9 
 
 		 276 aa  48.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0754  TonB family protein  24.17 
 
 		 317 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  28.57 
 
 		 292 aa  42.4  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0280  TonB domain-containing protein  38.98 
 
 		 341 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.256703  hitchhiker  0.000121849 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>