127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3091 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  100 
 
 
294 aa  582  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  66.55 
 
 
291 aa  377  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  66.19 
 
 
291 aa  376  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01600  TonB protein  70.07 
 
 
291 aa  373  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  36.99 
 
 
292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4994  TonB family protein  35.76 
 
 
301 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416898  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4868  TonB family protein  35.76 
 
 
301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  35.96 
 
 
300 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0486  TonB, C-terminal  35.4 
 
 
300 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.544308  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5044  TonB family protein  34.68 
 
 
301 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.805089  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  34.69 
 
 
297 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5036  tonB domain protein  35.23 
 
 
297 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  34.04 
 
 
319 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  34.98 
 
 
298 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2507  TonB-like protein  32.23 
 
 
316 aa  149  7e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  33.33 
 
 
288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0937  TonB family protein  34.32 
 
 
288 aa  146  5e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164985  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5310  TonB-like  35.36 
 
 
299 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0148466  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4324  TonB family protein  31.82 
 
 
286 aa  142  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2576  TonB-like protein  32.76 
 
 
294 aa  140  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0854385 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3679  TonB family protein  35.61 
 
 
307 aa  138  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3908  TonB, C-terminal  32.64 
 
 
296 aa  135  7.000000000000001e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3636  hypothetical protein  32.27 
 
 
294 aa  129  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2337  TonB-dependent receptor, putative  38.03 
 
 
279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  32.21 
 
 
310 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03160  TonB protein  31.78 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.444555  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  33.69 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0537  TonB-like  42.25 
 
 
333 aa  115  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  31.64 
 
 
300 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3055  TonB-like protein  29.88 
 
 
328 aa  99.4  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.719984  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0588  TonB-like  29.2 
 
 
323 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0624  hypothetical protein  31.02 
 
 
323 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2856  TonB, C-terminal  30.92 
 
 
306 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3022  TonB family protein  28.23 
 
 
304 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.364821  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3406  TonB family protein  30.53 
 
 
304 aa  85.9  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2612  TonB family protein  27.89 
 
 
304 aa  85.5  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2778  hypothetical protein  30.29 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.241997 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0842  TonB family protein  27.44 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0510  TonB family protein  36.04 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3412  TonB-like  30.42 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1483  TonB family protein  28.37 
 
 
287 aa  76.3  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00129671  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  47.06 
 
 
292 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3655  TonB family protein  26.37 
 
 
304 aa  72  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2965  TonB family protein  26.03 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3981  TonB family protein  37.17 
 
 
296 aa  68.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000313556 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3200  periplasmic protein/ biopolymer transport  37.6 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.917881  normal  0.0459006 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0936  TonB family protein  26.87 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1088  TonB-like  26.49 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.764781  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2711  GETHR pentapeptide  40.32 
 
 
654 aa  60.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.653885  hitchhiker  0.000850272 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0216  TonB family protein  28.4 
 
 
295 aa  60.1  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  39.24 
 
 
268 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  38.96 
 
 
268 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2196  TonB family protein  25.94 
 
 
287 aa  55.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  41.56 
 
 
264 aa  55.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  38.96 
 
 
268 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0401  TonB family protein  23.53 
 
 
274 aa  54.7  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.236004  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  48.28 
 
 
285 aa  52.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  43.1 
 
 
237 aa  51.6  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  35.42 
 
 
263 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2668  TonB family protein  35.63 
 
 
252 aa  50.8  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1978  TonB family protein  32 
 
 
275 aa  50.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.284174  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1646  TonB family protein  32 
 
 
275 aa  50.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0972936  hitchhiker  0.00122452 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  41.67 
 
 
308 aa  50.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  37.66 
 
 
289 aa  50.1  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2801  TonB family protein  26.23 
 
 
282 aa  49.7  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  34.94 
 
 
244 aa  49.7  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  31.58 
 
 
251 aa  49.3  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  37.18 
 
 
290 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2389  TonB-dependent receptor, putative  31.37 
 
 
245 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  32.29 
 
 
248 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  41.18 
 
 
235 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  37.18 
 
 
286 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  38.33 
 
 
279 aa  48.1  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  41.38 
 
 
269 aa  48.1  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  34.21 
 
 
248 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2127  TonB-like  46.3 
 
 
330 aa  47.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0144571  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  37.97 
 
 
258 aa  47.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  42.37 
 
 
251 aa  46.6  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  42.86 
 
 
242 aa  47  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  44 
 
 
270 aa  47  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  42.86 
 
 
242 aa  47  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  53.33 
 
 
287 aa  47  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  34.48 
 
 
305 aa  46.6  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  50 
 
 
285 aa  46.6  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  42.86 
 
 
325 aa  46.2  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  30.95 
 
 
336 aa  46.2  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2278  TonB family protein  39.53 
 
 
247 aa  46.2  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.453264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0339  TonB family protein  32.74 
 
 
597 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1467  TonB family protein  35.21 
 
 
265 aa  46.2  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132532  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  33.8 
 
 
261 aa  45.8  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  51.11 
 
 
288 aa  45.8  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  43.1 
 
 
265 aa  45.8  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  31.58 
 
 
246 aa  45.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  40.26 
 
 
284 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  33.72 
 
 
295 aa  45.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1262  protein TonB  28.95 
 
 
235 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  35.62 
 
 
267 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  35.62 
 
 
267 aa  45.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  35.62 
 
 
267 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2079  TonB family protein  35.87 
 
 
126 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0849144 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>