95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1467 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1467  TonB family protein  100 
 
 
265 aa  517  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132532  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  31.95 
 
 
244 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  53 
 
 
261 aa  122  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  33.58 
 
 
251 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2065  TonB family protein  36.63 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4259  TonB family protein  36.88 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  37.5 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  37.5 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  31.62 
 
 
295 aa  62.4  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1368  TonB family protein  22.76 
 
 
277 aa  60.8  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0401  TonB family protein  28.77 
 
 
274 aa  59.7  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.236004  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  25.35 
 
 
248 aa  59.7  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  28.69 
 
 
264 aa  58.9  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  30.7 
 
 
292 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  33.04 
 
 
289 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  36.59 
 
 
246 aa  56.2  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0845  TonB  24.29 
 
 
227 aa  55.8  0.0000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1512  TonB family protein  34.33 
 
 
316 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  34.15 
 
 
239 aa  52.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1566  TonB family protein  30.77 
 
 
251 aa  52.8  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0644  TonB-like  40.24 
 
 
233 aa  52  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1242  protein TonB  34.48 
 
 
283 aa  52  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.510655  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  33.33 
 
 
447 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  36.23 
 
 
495 aa  51.2  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  26.23 
 
 
268 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1651  protein TonB  38.37 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.350866  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  26.23 
 
 
268 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1004  TonB-like  30 
 
 
239 aa  51.2  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  23.72 
 
 
268 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2668  TonB family protein  27.35 
 
 
252 aa  50.4  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0392  ATP-binding protein  33.33 
 
 
257 aa  50.1  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.511226  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  31.25 
 
 
324 aa  49.7  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1262  protein TonB  28.92 
 
 
235 aa  49.3  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  32.38 
 
 
248 aa  48.9  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  27.78 
 
 
219 aa  48.9  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2159  TonB family protein  23.67 
 
 
277 aa  48.5  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0466  TonB domain protein  26.88 
 
 
217 aa  48.5  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  31.87 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  36.99 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1621  TonB-dependent receptor, putative, authentic frameshift  34.57 
 
 
227 aa  47.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614853  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  32.89 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3111  TonB, C-terminal  45.45 
 
 
174 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  26.89 
 
 
256 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  25 
 
 
308 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1845  TonB family protein  30.68 
 
 
268 aa  47.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3324  TonB family protein  27.34 
 
 
258 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0714054  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  30.56 
 
 
295 aa  47.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0878  TonB family protein  32.94 
 
 
248 aa  47  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  28.16 
 
 
193 aa  47  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  28.41 
 
 
220 aa  46.6  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0937  TonB family protein  31.15 
 
 
288 aa  46.6  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164985  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2219  TonB family protein  26.15 
 
 
290 aa  46.2  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.479729  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  32.23 
 
 
336 aa  46.2  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  31.03 
 
 
294 aa  45.8  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  36.36 
 
 
242 aa  45.8  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  36.36 
 
 
242 aa  45.8  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  32.14 
 
 
248 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  35.38 
 
 
411 aa  44.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  34.72 
 
 
291 aa  45.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  34.72 
 
 
291 aa  45.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  32.93 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  28.04 
 
 
264 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2527  TonB family protein  30.56 
 
 
390 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.700162  normal  0.957554 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  37.18 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2185  transport protein TonB  31.51 
 
 
249 aa  43.9  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.150473  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  29.87 
 
 
267 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  36.51 
 
 
267 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  29.33 
 
 
252 aa  43.5  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  34.21 
 
 
441 aa  43.5  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3288  TonB family protein  33.33 
 
 
194 aa  43.9  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.634309  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  32.05 
 
 
238 aa  43.9  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  29.87 
 
 
267 aa  43.5  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  37.5 
 
 
269 aa  43.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  32.22 
 
 
300 aa  43.1  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0168  TonB family protein  45 
 
 
253 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.500537 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1470  TonB family protein  29.76 
 
 
279 aa  43.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2092  TonB-like protein  27.1 
 
 
264 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.014367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3965  TonB family protein  28.04 
 
 
264 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  30.95 
 
 
248 aa  42.7  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2295  transport protein TonB  31.94 
 
 
251 aa  42.7  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  38 
 
 
248 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  26.83 
 
 
265 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1946  transport protein TonB  42 
 
 
256 aa  42.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.940635  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  38 
 
 
244 aa  42  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  27.27 
 
 
292 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  38 
 
 
248 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  25.61 
 
 
251 aa  42  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  32.79 
 
 
286 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2055  transport protein TonB  42 
 
 
256 aa  42.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2147  transport protein TonB  42 
 
 
252 aa  42.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  0.047468 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  38 
 
 
246 aa  42  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  38 
 
 
246 aa  42  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2512  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  28.43 
 
 
411 aa  42  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.929963  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  38 
 
 
246 aa  42  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  25.26 
 
 
289 aa  42  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>