28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2079 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2079  TonB family protein  100 
 
 
126 aa  235  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0849144 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  30.34 
 
 
279 aa  48.9  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  41.18 
 
 
239 aa  47.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2581  TonB family protein  35.48 
 
 
294 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.632604  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  29.35 
 
 
267 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  29.35 
 
 
267 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  29.35 
 
 
267 aa  47  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0922  putative TonB protein  35.48 
 
 
294 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.702209  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  33.04 
 
 
219 aa  45.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0994  TonB family protein  49.46 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  35.87 
 
 
294 aa  45.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  42.19 
 
 
270 aa  45.4  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  48.89 
 
 
276 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  36.47 
 
 
310 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0957  TonB family protein  48.39 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.826654 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  31.52 
 
 
244 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  40.79 
 
 
291 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  40.79 
 
 
291 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2994  TonB family protein  40.3 
 
 
294 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.7532  normal  0.152882 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  32.73 
 
 
246 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3679  TonB family protein  43.94 
 
 
307 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0510  TonB family protein  33.64 
 
 
250 aa  41.2  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  29.27 
 
 
258 aa  40.8  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  55.88 
 
 
287 aa  41.2  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  33.82 
 
 
268 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2906  TonB-like  33.73 
 
 
235 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155829  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  41.18 
 
 
243 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  33.82 
 
 
268 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>