177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3668 on replicon NC_010815
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  100 
 
 
244 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  46.67 
 
 
251 aa  187  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1467  TonB family protein  48.42 
 
 
265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132532  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  55.56 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  36.79 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  42.7 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1566  TonB family protein  33.03 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1512  TonB family protein  43.82 
 
 
316 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  33.33 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1004  TonB-like  23.58 
 
 
239 aa  64.7  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  37.08 
 
 
164 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  43.66 
 
 
202 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1368  TonB family protein  30.77 
 
 
277 aa  61.2  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  33.51 
 
 
289 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  27.78 
 
 
220 aa  60.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  38.64 
 
 
248 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2065  TonB family protein  37.5 
 
 
201 aa  59.7  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  37.76 
 
 
292 aa  59.3  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  42.65 
 
 
279 aa  58.9  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  37.5 
 
 
248 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  45.45 
 
 
280 aa  57.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  29.35 
 
 
324 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  25.1 
 
 
264 aa  57.4  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  51.02 
 
 
270 aa  56.6  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  26.1 
 
 
291 aa  56.6  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  38.67 
 
 
276 aa  57  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  26.1 
 
 
291 aa  56.6  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0392  ATP-binding protein  33.33 
 
 
257 aa  56.2  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.511226  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0937  TonB family protein  41.27 
 
 
288 aa  56.6  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164985  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4259  TonB family protein  37.33 
 
 
241 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  32.88 
 
 
251 aa  55.5  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  42.86 
 
 
300 aa  55.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  40.28 
 
 
295 aa  54.7  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0716  TonB family protein  38.46 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  24.48 
 
 
289 aa  54.3  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  34.65 
 
 
239 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  34.52 
 
 
308 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0878  TonB family protein  30.59 
 
 
248 aa  53.9  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2219  TonB family protein  24.79 
 
 
290 aa  54.3  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.479729  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  46.55 
 
 
269 aa  53.1  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1027  TonB, C-terminal  30.95 
 
 
235 aa  52.8  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  36.36 
 
 
248 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0401  TonB family protein  35 
 
 
274 aa  52.4  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.236004  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1651  protein TonB  38.36 
 
 
241 aa  52.4  0.000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.350866  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  35.23 
 
 
244 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  36.17 
 
 
243 aa  52  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  36.17 
 
 
243 aa  52  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  37.31 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0624  hypothetical protein  38.98 
 
 
323 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  33.72 
 
 
267 aa  51.6  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2092  TonB-like protein  34.31 
 
 
264 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.014367 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  36.17 
 
 
243 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  35.23 
 
 
245 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0588  TonB-like  38.98 
 
 
323 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  33.72 
 
 
267 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  33.72 
 
 
267 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0845  TonB  23.18 
 
 
227 aa  51.2  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  26.25 
 
 
212 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  36.9 
 
 
258 aa  50.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  34.67 
 
 
263 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  24.64 
 
 
305 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2159  TonB family protein  36.84 
 
 
277 aa  50.8  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  22.73 
 
 
219 aa  50.8  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  33.33 
 
 
245 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1242  protein TonB  31.03 
 
 
283 aa  50.8  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.510655  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2337  TonB-dependent receptor, putative  39.06 
 
 
279 aa  50.1  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0644  TonB-like  30.11 
 
 
233 aa  50.1  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  38.98 
 
 
310 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  29.41 
 
 
268 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  31.25 
 
 
268 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  34.94 
 
 
294 aa  50.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  46.94 
 
 
273 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  30.23 
 
 
242 aa  49.7  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3636  hypothetical protein  44.07 
 
 
294 aa  49.7  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3965  TonB family protein  32.32 
 
 
264 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  30.23 
 
 
242 aa  49.7  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2668  TonB family protein  29.06 
 
 
252 aa  49.7  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  32.29 
 
 
235 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  33.33 
 
 
264 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0730  TonB-like  30.3 
 
 
225 aa  49.3  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.210175  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0419  tonB-related protein  33.72 
 
 
143 aa  49.3  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  30.21 
 
 
268 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  34.21 
 
 
228 aa  48.9  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  37.04 
 
 
447 aa  48.9  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  35.37 
 
 
221 aa  48.9  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  28.72 
 
 
390 aa  48.9  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0537  TonB-like  36.92 
 
 
333 aa  48.9  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  44.9 
 
 
274 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  26.17 
 
 
292 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3679  TonB family protein  37.21 
 
 
307 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  37.1 
 
 
495 aa  48.5  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  27.46 
 
 
336 aa  48.5  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  41.03 
 
 
238 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0284  TonB family protein  24.51 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1262  protein TonB  23.38 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4005  TonB family protein  34.18 
 
 
248 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2576  TonB-like protein  32.86 
 
 
294 aa  47.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0854385 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2541  periplasmic protein TonB  38.71 
 
 
272 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.70786e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0708  TonB family protein  30.68 
 
 
256 aa  46.6  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  36.36 
 
 
243 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>