46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0644 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0644  TonB-like  100 
 
 
233 aa  456  1e-127  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0849  TonB, putative  29.72 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00146132  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0845  TonB  29.44 
 
 
227 aa  59.7  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0271  TonB-like protein  31.02 
 
 
233 aa  57  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1621  TonB-dependent receptor, putative, authentic frameshift  25.62 
 
 
227 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614853  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  35.63 
 
 
292 aa  55.5  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1242  protein TonB  36.78 
 
 
283 aa  54.7  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.510655  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  24.81 
 
 
258 aa  54.3  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1004  TonB-like  25.51 
 
 
239 aa  53.9  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1262  protein TonB  30.04 
 
 
235 aa  53.9  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  37.8 
 
 
261 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1467  TonB family protein  40.24 
 
 
265 aa  53.5  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132532  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  34.48 
 
 
258 aa  52.4  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1566  TonB family protein  26.56 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1651  protein TonB  27.5 
 
 
241 aa  50.4  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.350866  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  31.82 
 
 
269 aa  50.4  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0392  ATP-binding protein  33.33 
 
 
257 aa  49.7  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.511226  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  30.11 
 
 
244 aa  49.7  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  34.18 
 
 
267 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2159  TonB family protein  28.69 
 
 
277 aa  48.1  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  34.18 
 
 
267 aa  48.1  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4259  TonB family protein  38.89 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  34.18 
 
 
267 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  33.78 
 
 
248 aa  47.4  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0878  TonB family protein  32.14 
 
 
248 aa  47  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7326  TonB-like protein  35.09 
 
 
230 aa  46.2  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  32.1 
 
 
291 aa  46.6  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  36.49 
 
 
251 aa  46.2  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2065  TonB family protein  30.77 
 
 
201 aa  45.8  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  32.14 
 
 
265 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1368  TonB family protein  30.51 
 
 
277 aa  44.7  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  28.74 
 
 
485 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0284  TonB family protein  33.33 
 
 
250 aa  44.7  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5008  TonB-like protein  30 
 
 
232 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.106171 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  35.48 
 
 
248 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  35.48 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1732  TonB family protein  28.21 
 
 
233 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal  0.423911 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  36.21 
 
 
202 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1717  TonB family protein  28.21 
 
 
233 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  36.21 
 
 
164 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6361  TonB-like  28.21 
 
 
233 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0284134  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  29.07 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  21.9 
 
 
220 aa  43.1  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  29.49 
 
 
266 aa  42.7  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  31.34 
 
 
308 aa  42.7  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  26.1 
 
 
249 aa  42  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>