35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0878 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0878  TonB family protein  100 
 
 
248 aa  478  1e-134  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0845  TonB  34 
 
 
227 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1262  protein TonB  38.95 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0284  TonB family protein  39.33 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1621  TonB-dependent receptor, putative, authentic frameshift  30.77 
 
 
227 aa  63.2  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614853  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0466  TonB domain protein  35.11 
 
 
217 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1242  protein TonB  33.67 
 
 
283 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.510655  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1651  protein TonB  35.96 
 
 
241 aa  59.7  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.350866  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  30.59 
 
 
261 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  30.59 
 
 
244 aa  55.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0716  TonB family protein  24.2 
 
 
212 aa  52  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1004  TonB-like  23.6 
 
 
239 aa  51.6  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0849  TonB, putative  25.75 
 
 
249 aa  49.7  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00146132  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  22.67 
 
 
220 aa  49.7  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3339  TonB family protein  27.63 
 
 
284 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000004715  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  34.48 
 
 
246 aa  48.9  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  21.43 
 
 
292 aa  48.9  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0644  TonB-like  32.14 
 
 
233 aa  47.8  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1467  TonB family protein  32.94 
 
 
265 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132532  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  31.4 
 
 
264 aa  48.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1020  TonB family protein  25.33 
 
 
290 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00268646  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1053  TonB family protein  26 
 
 
289 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0250994  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  22.89 
 
 
202 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  28.43 
 
 
308 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  22.89 
 
 
164 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0951  TonB family protein  25.85 
 
 
295 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00168123  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1566  TonB family protein  29.07 
 
 
251 aa  45.8  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  32.05 
 
 
215 aa  45.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2219  TonB family protein  26.79 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.479729  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  39.29 
 
 
223 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  34 
 
 
193 aa  43.9  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0392  ATP-binding protein  25 
 
 
257 aa  43.5  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.511226  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  35.48 
 
 
251 aa  43.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2507  TonB-like protein  41.43 
 
 
316 aa  42.4  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  38.78 
 
 
233 aa  42  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>