30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0716 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0716  TonB family protein  100 
 
 
212 aa  428  1e-119  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0845  TonB  36.14 
 
 
227 aa  75.1  0.0000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0466  TonB domain protein  32.73 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1262  protein TonB  36.61 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1651  protein TonB  30.24 
 
 
241 aa  64.3  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.350866  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  33.33 
 
 
239 aa  58.9  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1621  TonB-dependent receptor, putative, authentic frameshift  30.92 
 
 
227 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614853  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1242  protein TonB  35 
 
 
283 aa  55.8  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.510655  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  28.32 
 
 
268 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  36.67 
 
 
244 aa  54.7  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0284  TonB family protein  29.03 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  27.08 
 
 
248 aa  52  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  32.61 
 
 
268 aa  51.6  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  32.61 
 
 
268 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  31.31 
 
 
261 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  33.73 
 
 
305 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1624  TonB-like  40.62 
 
 
285 aa  47.4  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0946322  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  27.7 
 
 
292 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0878  TonB family protein  26.97 
 
 
248 aa  45.8  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  29.29 
 
 
246 aa  45.8  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0849  TonB, putative  25.81 
 
 
249 aa  45.4  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00146132  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  24.26 
 
 
251 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  29.67 
 
 
263 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  26.21 
 
 
324 aa  43.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1004  TonB-like  25.65 
 
 
239 aa  42.7  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2065  TonB family protein  30.08 
 
 
201 aa  42.7  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0271  TonB-like protein  25.35 
 
 
233 aa  42  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1338  TonB-like protein  33.72 
 
 
238 aa  42  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.101224 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0392  ATP-binding protein  31.82 
 
 
257 aa  41.6  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.511226  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0708  TonB family protein  25.13 
 
 
256 aa  41.6  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>