118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0441 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  100 
 
 		 305 aa  559  1e-158  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  29.84 
 
 		 268 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  31.61 
 
 		 268 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  29.39 
 
 		 268 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  27.27 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  41.3 
 
 		 250 aa  78.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1845  TonB family protein  42.24 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  37.63 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  37.63 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  33.33 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  28.34 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  31.46 
 
 		 220 aa  68.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  38.64 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2389  TonB-dependent receptor, putative  37.25 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  35.48 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  29.76 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  35.48 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  35.48 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  34.07 
 
 		 246 aa  65.5  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  26.76 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  33.33 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  36.56 
 
 		 244 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  33.05 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  38.64 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3965  TonB family protein  35.24 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  35.48 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1850  putative tonB protein  29.21 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.473086  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  35.87 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  35.48 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  35.24 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  39.13 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  32.22 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  25.63 
 
 		 248 aa  62  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2092  TonB-like protein  34.29 
 
 		 264 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.014367 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  47.37 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  32.09 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  52.08 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  25.52 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1487  TonB family protein  35.11 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.39629 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  47.95 
 
 		 489 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7000  hypothetical protein  38.37 
 
 		 154 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695854 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  27.35 
 
 		 267 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  27.35 
 
 		 267 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  27.35 
 
 		 267 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10610  TonB protein  30.58 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.94051  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  45.45 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  32.26 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  33.33 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  28.57 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  28.18 
 
 		 242 aa  55.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  39.44 
 
 		 251 aa  55.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  22.38 
 
 		 244 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  28.18 
 
 		 242 aa  55.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  46.88 
 
 		 926 aa  54.3  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  37.08 
 
 		 237 aa  55.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  25.45 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2512  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  30.77 
 
 		 411 aa  53.5  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.929963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  28.11 
 
 		 288 aa  53.1  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1988  group-specific protein  26.76 
 
 		 928 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1158  TonB-like  32.97 
 
 		 297 aa  52.8  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000294867  decreased coverage  0.0031097 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  37.84 
 
 		 522 aa  52.8  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3545  putative energy transducer TonB  33.33 
 
 		 269 aa  52.8  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2159  TonB family protein  24.2 
 
 		 277 aa  52.4  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1517  TonB-like  33.66 
 
 		 264 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  31.63 
 
 		 630 aa  51.6  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1027  TonB, C-terminal  28.26 
 
 		 235 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0708  TonB family protein  26.75 
 
 		 256 aa  51.6  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  28.26 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  35.82 
 
 		 292 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  35.14 
 
 		 2272 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  26.99 
 
 		 250 aa  50.4  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  40 
 
 		 261 aa  50.4  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  40.54 
 
 		 1261 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2906  TonB-like  32.89 
 
 		 235 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155829  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1469  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.75 
 
 		 445 aa  50.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0854841  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2101  TonB family protein  33.33 
 
 		 171 aa  50.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.483665  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  32.38 
 
 		 289 aa  49.3  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1269  TonB protein  33.66 
 
 		 263 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111983  normal  0.123169 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2307  TonB like protein  33.66 
 
 		 263 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.242598  normal  0.294418 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  42.39 
 
 		 539 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1631  sporulation domain-containing protein  54.69 
 
 		 525 aa  48.5  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  25.18 
 
 		 2449 aa  48.9  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0392  ATP-binding protein  25.81 
 
 		 257 aa  48.9  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.511226  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  31.76 
 
 		 235 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3402  hypothetical protein  29.29 
 
 		 431 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  35.14 
 
 		 2179 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  30.77 
 
 		 991 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  43.42 
 
 		 423 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  22.82 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  31.17 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  25.54 
 
 		 251 aa  47  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0789  TonB-like protein  33.77 
 
 		 269 aa  46.2  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000813282  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3324  TonB family protein  28.57 
 
 		 258 aa  46.2  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0714054  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23491  hypothetical protein  50 
 
 		 480 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.425384 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  29.27 
 
 		 1888 aa  46.2  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  32.14 
 
 		 1070 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  32.14 
 
 		 1070 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1434  hypothetical protein  33.33 
 
 		 772 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.709183  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  44.44 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  35.21 
 
 		 411 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>