117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1307 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  100 
 
 		 263 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3545  putative energy transducer TonB  53.15 
 
 		 269 aa  252  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  45.1 
 
 		 264 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2092  TonB-like protein  44.28 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.014367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3965  TonB family protein  45.35 
 
 		 264 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1517  TonB-like  44.31 
 
 		 264 aa  183  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1269  TonB protein  41.29 
 
 		 263 aa  161  8.000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111983  normal  0.123169 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2307  TonB like protein  41.29 
 
 		 263 aa  161  8.000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.242598  normal  0.294418 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1133  TonB family protein  36.96 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0749  TonB-like  27.63 
 
 		 269 aa  88.2  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  26.38 
 
 		 267 aa  78.6  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  26.38 
 
 		 267 aa  78.6  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  34.07 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  27.43 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  37.78 
 
 		 269 aa  75.5  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  28.21 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7000  hypothetical protein  35.48 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695854 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  25.44 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  32.95 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1982  TonB-like  35.63 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  34.07 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  34.07 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  37.36 
 
 		 317 aa  67  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  34.07 
 
 		 268 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  34.07 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  26.67 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0922  putative TonB protein  37.36 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.702209  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  24.05 
 
 		 292 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2581  TonB family protein  37.36 
 
 		 294 aa  65.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.632604  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  23.73 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  26.71 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  27.08 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  27.08 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  34.78 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  32.46 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  40 
 
 		 324 aa  62.4  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  36 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4275  TonB family protein  35.96 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  25.66 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  27.72 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2906  TonB-like  37.5 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155829  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  30.23 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  27.73 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  31.67 
 
 		 243 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2230  energy transducer  28.19 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  30.7 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  30.7 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  27.52 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0174  TonB-dependent colicin receptor protein, putative  24.9 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  28.1 
 
 		 495 aa  55.5  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  31.18 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2359  TonB-like  32.95 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0567  TonB family protein  33.66 
 
 		 182 aa  53.9  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.584619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2994  TonB family protein  30.4 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.7532  normal  0.152882 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3748  TonB family protein  31.17 
 
 		 88 aa  53.1  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  31.52 
 
 		 248 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2528  TonB family protein  31.25 
 
 		 393 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.962714 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  31.82 
 
 		 411 aa  52.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  32.61 
 
 		 244 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  30 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  25.44 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1487  TonB family protein  29.35 
 
 		 386 aa  51.2  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.39629 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  23.55 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  27.27 
 
 		 246 aa  48.9  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  26.37 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  29.82 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1668  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 308 aa  47.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  27.59 
 
 		 235 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  29.27 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1173  TonB family protein  23.69 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.140977  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2407  TonB family protein  48 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3167  protein TolA  38.81 
 
 		 331 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1027  TonB, C-terminal  25 
 
 		 235 aa  47  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3402  hypothetical protein  37.1 
 
 		 431 aa  47.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  28.09 
 
 		 295 aa  46.6  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2454  protein TolA  36.36 
 
 		 351 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  27.72 
 
 		 289 aa  46.6  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  38.46 
 
 		 242 aa  46.2  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  38.46 
 
 		 242 aa  46.2  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0864  TonB family protein  40.98 
 
 		 142 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0513  TonB-like  44.07 
 
 		 163 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0992  TonB family protein  44.07 
 
 		 163 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0403121  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  28.57 
 
 		 284 aa  45.4  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0318  TonB-like  37.5 
 
 		 351 aa  45.4  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.782104  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0852  TonB family protein  40.98 
 
 		 167 aa  45.4  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.802184  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0801  TonB family protein  37.5 
 
 		 351 aa  45.4  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0770  protein TolA  37.5 
 
 		 351 aa  45.4  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0734059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0794  TonB, C-terminal  36.67 
 
 		 378 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2127  TonB-like  35.62 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0144571  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  23.83 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3890  TonB/TolA-like protein  35.94 
 
 		 351 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1614  TonB protein  25.32 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0952  TonB family protein  46 
 
 		 163 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2144  TonB family protein  36.59 
 
 		 296 aa  43.9  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0708  TonB family protein  31.82 
 
 		 256 aa  43.5  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1845  TonB family protein  23.86 
 
 		 268 aa  43.1  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1184  TonB family protein  35.29 
 
 		 249 aa  43.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0855  TonB family protein  38.37 
 
 		 353 aa  43.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0725  TonB family protein  31.31 
 
 		 282 aa  43.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398336  normal  0.51938 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0510  TonB family protein  32 
 
 		 250 aa  42.7  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>