49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0864 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0864  TonB family protein  100 
 
 		 142 aa  288  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0852  TonB family protein  98.59 
 
 		 167 aa  285  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.802184  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0992  TonB family protein  81.88 
 
 		 163 aa  224  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0403121  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0513  TonB-like  81.88 
 
 		 163 aa  224  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0952  TonB family protein  81.16 
 
 		 163 aa  223  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2407  TonB family protein  81.88 
 
 		 343 aa  222  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4095  TonB-like protein  84.78 
 
 		 163 aa  205  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.134402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3417  TonB protein  62.5 
 
 		 178 aa  176  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1064  TonB family protein  63.83 
 
 		 180 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.381212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1577  TonB domain-containing protein  57.75 
 
 		 164 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3024  TonB domain-containing protein  57.66 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3058  TonB domain-containing protein  57.66 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0664  TonB protein  62.71 
 
 		 170 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0257163  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2105  TonB domain-containing protein  56.93 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0973726  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1972  TonB domain-containing protein  56.93 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.268921  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2959  TonB domain-containing protein  56.93 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2640  TonB domain-containing protein  56.93 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0807  TonB domain-containing protein  56.93 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22065  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  43.55 
 
 		 267 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  43.55 
 
 		 267 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  35.05 
 
 		 495 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  32.99 
 
 		 411 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0749  TonB-like  38.46 
 
 		 269 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1425  hypothetical protein  26.67 
 
 		 169 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  40.98 
 
 		 263 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  28.71 
 
 		 248 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0138  TonB family protein  37.1 
 
 		 354 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  35.94 
 
 		 269 aa  45.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  30.23 
 
 		 243 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  30.23 
 
 		 243 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  32.05 
 
 		 248 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  43.48 
 
 		 265 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2906  TonB-like  33.86 
 
 		 235 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155829  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  42.59 
 
 		 286 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  43.48 
 
 		 291 aa  43.9  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  29.17 
 
 		 243 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3545  putative energy transducer TonB  37.31 
 
 		 269 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  48.89 
 
 		 451 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2127  TonB-like  43.48 
 
 		 330 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0144571  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2092  TonB-like protein  35.59 
 
 		 264 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.014367 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  36.71 
 
 		 308 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  38 
 
 		 264 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  26.67 
 
 		 244 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  35.71 
 
 		 267 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  35.71 
 
 		 267 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  35.71 
 
 		 267 aa  40.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  37.5 
 
 		 266 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  40 
 
 		 258 aa  40  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3297  TonB family protein  35.53 
 
 		 470 aa  40  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.158532  normal  0.575713 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>