18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1425 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1425  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  346  7e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1044  hypothetical protein  60.26 
 
 		 157 aa  185  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1124  hypothetical protein  60.26 
 
 		 157 aa  184  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.408602  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3924  hypothetical protein  54.44 
 
 		 180 aa  171  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1012  hypothetical protein  68.93 
 
 		 169 aa  164  6.9999999999999995e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1428  hypothetical protein  67.96 
 
 		 175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2126  hypothetical protein  61.98 
 
 		 135 aa  148  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101243 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1636  hypothetical protein  45.52 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1959  hypothetical protein  34 
 
 		 158 aa  57.4  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0485846  normal  0.959399 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0513  TonB-like  28.33 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0992  TonB family protein  28.33 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0403121  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3417  TonB protein  29.94 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0952  TonB family protein  28.33 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1064  TonB family protein  31.25 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.381212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0852  TonB family protein  26.67 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.802184  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2407  TonB family protein  28.7 
 
 		 343 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0864  TonB family protein  26.67 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1577  TonB domain-containing protein  31.37 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>