41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0664 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0664  TonB protein  100 
 
 
170 aa  345  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0257163  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1064  TonB family protein  73.75 
 
 
180 aa  229  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.381212  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3417  TonB protein  70.99 
 
 
178 aa  229  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2407  TonB family protein  61.43 
 
 
343 aa  179  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0992  TonB family protein  62.04 
 
 
163 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0403121  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0513  TonB-like  62.04 
 
 
163 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0952  TonB family protein  61.31 
 
 
163 aa  175  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.798  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0864  TonB family protein  58.16 
 
 
142 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378576  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0852  TonB family protein  57.66 
 
 
167 aa  158  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.802184  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3024  TonB domain-containing protein  62.77 
 
 
164 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3058  TonB domain-containing protein  62.77 
 
 
164 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1577  TonB domain-containing protein  53.57 
 
 
164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2105  TonB domain-containing protein  62.77 
 
 
164 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0973726  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1972  TonB domain-containing protein  62.77 
 
 
164 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.268921  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0807  TonB domain-containing protein  62.77 
 
 
164 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22065  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2640  TonB domain-containing protein  62.77 
 
 
164 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2959  TonB domain-containing protein  62.77 
 
 
164 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4095  TonB-like protein  60.58 
 
 
163 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.134402  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1425  hypothetical protein  28.66 
 
 
169 aa  53.9  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  30.51 
 
 
243 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  30.51 
 
 
243 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  30.51 
 
 
243 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  36.62 
 
 
265 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  39.29 
 
 
267 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  39.29 
 
 
267 aa  45.8  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  39.29 
 
 
267 aa  45.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  30 
 
 
248 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  26.47 
 
 
248 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2126  hypothetical protein  28.67 
 
 
135 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.101243 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  40.91 
 
 
251 aa  43.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  33.87 
 
 
267 aa  43.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  33.87 
 
 
267 aa  43.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1012  hypothetical protein  28.7 
 
 
169 aa  42.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  42 
 
 
258 aa  42.4  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0138  TonB family protein  40.91 
 
 
354 aa  42.4  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3924  hypothetical protein  27.48 
 
 
180 aa  42.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0749  TonB-like  28.12 
 
 
269 aa  42  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1044  hypothetical protein  28.03 
 
 
157 aa  41.2  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1124  hypothetical protein  28.03 
 
 
157 aa  41.2  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.408602  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1636  hypothetical protein  28.45 
 
 
170 aa  41.2  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1428  hypothetical protein  27.78 
 
 
175 aa  41.2  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.177698 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>