45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3417 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3417  TonB protein  100 
 
 		 178 aa  357  5e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1064  TonB family protein  84.44 
 
 		 180 aa  303  6e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.381212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0664  TonB protein  69.14 
 
 		 170 aa  193  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0257163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2407  TonB family protein  67.88 
 
 		 343 aa  192  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0952  TonB family protein  66.91 
 
 		 163 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0513  TonB-like  66.91 
 
 		 163 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0992  TonB family protein  66.91 
 
 		 163 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0403121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0864  TonB family protein  62.5 
 
 		 142 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0852  TonB family protein  64.75 
 
 		 167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.802184  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1577  TonB domain-containing protein  60.9 
 
 		 164 aa  157  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3058  TonB domain-containing protein  64.96 
 
 		 164 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3024  TonB domain-containing protein  64.96 
 
 		 164 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4095  TonB-like protein  64.75 
 
 		 163 aa  154  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.134402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1972  TonB domain-containing protein  64.96 
 
 		 164 aa  148  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.268921  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2105  TonB domain-containing protein  64.96 
 
 		 164 aa  148  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0973726  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2959  TonB domain-containing protein  64.96 
 
 		 164 aa  148  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2640  TonB domain-containing protein  64.96 
 
 		 164 aa  148  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0807  TonB domain-containing protein  64.96 
 
 		 164 aa  148  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22065  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1425  hypothetical protein  29.94 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3924  hypothetical protein  31.48 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  38.71 
 
 		 267 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  38.71 
 
 		 267 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  39.44 
 
 		 265 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  29.41 
 
 		 243 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1636  hypothetical protein  31.73 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0749  TonB-like  37.1 
 
 		 269 aa  46.2  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  29.41 
 
 		 243 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  39.29 
 
 		 267 aa  45.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  29.41 
 
 		 243 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  39.29 
 
 		 267 aa  45.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  31.25 
 
 		 248 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  39.29 
 
 		 267 aa  45.8  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2126  hypothetical protein  28.37 
 
 		 135 aa  45.1  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101243 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  31.25 
 
 		 248 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  29.92 
 
 		 244 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  33.9 
 
 		 269 aa  43.9  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  44.19 
 
 		 251 aa  43.9  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0138  TonB family protein  40.91 
 
 		 354 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  39.58 
 
 		 495 aa  43.5  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1012  hypothetical protein  30.56 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1124  hypothetical protein  27.56 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.408602  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  42 
 
 		 258 aa  42.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1044  hypothetical protein  27.56 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1428  hypothetical protein  29.63 
 
 		 175 aa  42.4  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  35.04 
 
 		 266 aa  41.6  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>