12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1428 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1428  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  355  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1012  hypothetical protein  76.47 
 
 		 169 aa  231  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1124  hypothetical protein  69.23 
 
 		 157 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.408602  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1044  hypothetical protein  69.23 
 
 		 157 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1425  hypothetical protein  57.74 
 
 		 169 aa  189  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3924  hypothetical protein  54.27 
 
 		 180 aa  170  9e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2126  hypothetical protein  53.25 
 
 		 135 aa  152  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101243 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1636  hypothetical protein  52.14 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1959  hypothetical protein  31 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0485846  normal  0.959399 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3417  TonB protein  28.4 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2407  TonB family protein  25.93 
 
 		 343 aa  41.6  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0864  TonB family protein  24.68 
 
 		 142 aa  41.2  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378576  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>