21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2126 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2126  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  278  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.101243 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1044  hypothetical protein  58.6 
 
 
157 aa  172  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1124  hypothetical protein  58.6 
 
 
157 aa  172  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.408602  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1425  hypothetical protein  69.23 
 
 
169 aa  164  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3924  hypothetical protein  60.47 
 
 
180 aa  159  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1012  hypothetical protein  67.96 
 
 
169 aa  157  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1428  hypothetical protein  67.96 
 
 
175 aa  157  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1636  hypothetical protein  47.2 
 
 
170 aa  120  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3417  TonB protein  30.99 
 
 
178 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1959  hypothetical protein  31.3 
 
 
158 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0485846  normal  0.959399 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1064  TonB family protein  31.3 
 
 
180 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.381212  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2407  TonB family protein  30.58 
 
 
343 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0992  TonB family protein  29.2 
 
 
163 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0403121  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0513  TonB-like  29.2 
 
 
163 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0952  TonB family protein  29.2 
 
 
163 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.798  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0864  TonB family protein  27.46 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378576  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1577  TonB domain-containing protein  23.53 
 
 
164 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0664  TonB protein  26.92 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0257163  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0852  TonB family protein  30 
 
 
167 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.802184  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3058  TonB domain-containing protein  24.77 
 
 
164 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3024  TonB domain-containing protein  24.77 
 
 
164 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>