11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1012 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1012  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  345  2e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1428  hypothetical protein  77.65 
 
 		 175 aa  219  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1044  hypothetical protein  67.31 
 
 		 157 aa  212  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1124  hypothetical protein  67.31 
 
 		 157 aa  211  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.408602  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1425  hypothetical protein  54.04 
 
 		 169 aa  179  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3924  hypothetical protein  53.66 
 
 		 180 aa  165  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2126  hypothetical protein  53.29 
 
 		 135 aa  149  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101243 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1636  hypothetical protein  51.28 
 
 		 170 aa  120  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1959  hypothetical protein  32 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0485846  normal  0.959399 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3417  TonB protein  28.75 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1577  TonB domain-containing protein  28.75 
 
 		 164 aa  40.8  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>