15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1636 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1636  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  345  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1124  hypothetical protein  46.01 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.408602  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1044  hypothetical protein  46.01 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1425  hypothetical protein  41.32 
 
 		 169 aa  122  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3924  hypothetical protein  41.07 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1428  hypothetical protein  54.37 
 
 		 175 aa  118  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1012  hypothetical protein  53.4 
 
 		 169 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2126  hypothetical protein  47.2 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101243 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3417  TonB protein  31.73 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1064  TonB family protein  30.69 
 
 		 180 aa  45.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.381212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2407  TonB family protein  27.87 
 
 		 343 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1959  hypothetical protein  26.17 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0485846  normal  0.959399 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0513  TonB-like  28.7 
 
 		 163 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0992  TonB family protein  28.7 
 
 		 163 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0403121  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0952  TonB family protein  28.7 
 
 		 163 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.798  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>