12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3924 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3924  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  366  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1044  hypothetical protein  57.59 
 
 		 157 aa  174  8e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1124  hypothetical protein  57.05 
 
 		 157 aa  174  9e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.408602  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1425  hypothetical protein  54.44 
 
 		 169 aa  171  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1428  hypothetical protein  66.35 
 
 		 175 aa  155  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1012  hypothetical protein  65.38 
 
 		 169 aa  152  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2126  hypothetical protein  60.47 
 
 		 135 aa  146  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101243 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1636  hypothetical protein  50 
 
 		 170 aa  114  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1959  hypothetical protein  34.51 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0485846  normal  0.959399 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1064  TonB family protein  27.27 
 
 		 180 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.381212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3417  TonB protein  31.48 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2407  TonB family protein  28.57 
 
 		 343 aa  42.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>