38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4095 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4095  TonB-like protein  100 
 
 
163 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.134402  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0952  TonB family protein  88.96 
 
 
163 aa  266  7e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.798  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0992  TonB family protein  88.34 
 
 
163 aa  264  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0403121  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0513  TonB-like  88.34 
 
 
163 aa  264  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0852  TonB family protein  80.98 
 
 
167 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.802184  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0864  TonB family protein  85.21 
 
 
142 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378576  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2407  TonB family protein  84.05 
 
 
343 aa  239  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3417  TonB protein  63.4 
 
 
178 aa  186  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1064  TonB family protein  61.18 
 
 
180 aa  183  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.381212  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0664  TonB protein  58.17 
 
 
170 aa  153  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0257163  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1577  TonB domain-containing protein  56.33 
 
 
164 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3024  TonB domain-containing protein  61.31 
 
 
164 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3058  TonB domain-containing protein  61.31 
 
 
164 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2105  TonB domain-containing protein  60.58 
 
 
164 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0973726  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1972  TonB domain-containing protein  60.58 
 
 
164 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.268921  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2959  TonB domain-containing protein  60.58 
 
 
164 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2640  TonB domain-containing protein  60.58 
 
 
164 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0807  TonB domain-containing protein  60.58 
 
 
164 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22065  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1425  hypothetical protein  26.19 
 
 
169 aa  54.7  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  43.55 
 
 
267 aa  47.4  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  43.55 
 
 
267 aa  47.4  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  32.65 
 
 
495 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0749  TonB-like  40 
 
 
269 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  51.11 
 
 
451 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  46.81 
 
 
291 aa  45.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0138  TonB family protein  45.45 
 
 
354 aa  45.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  33 
 
 
266 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3748  TonB family protein  29.49 
 
 
88 aa  43.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  35.94 
 
 
269 aa  42.4  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  40.68 
 
 
263 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1982  TonB-like  43.48 
 
 
266 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153841  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7000  hypothetical protein  38 
 
 
154 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.695854 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  30.65 
 
 
248 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1636  hypothetical protein  26.17 
 
 
170 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  41.3 
 
 
279 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  30.65 
 
 
248 aa  41.6  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2127  TonB-like  41.3 
 
 
330 aa  41.2  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0144571  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3545  putative energy transducer TonB  47.5 
 
 
269 aa  40.4  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>