93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3468 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  100 
 
 		 266 aa  526  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  42.28 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  34.62 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  34.62 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  34.62 
 
 		 267 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  36.89 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0174  TonB-dependent colicin receptor protein, putative  27.34 
 
 		 248 aa  86.7  4e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  49.47 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  28.92 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  38.04 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  39 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  39 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  39.13 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  38.04 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  38 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  44.44 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  41.3 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  43.16 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  32.52 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  43.01 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  32.68 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  28.78 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  35.11 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  35.78 
 
 		 495 aa  68.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0749  TonB-like  30.19 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1982  TonB-like  38.89 
 
 		 266 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  38.04 
 
 		 290 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  35.96 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  39.13 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  27.8 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  27.8 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  47.3 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  39.13 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  38.46 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  27.17 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  32.81 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  27.59 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  30 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  34.04 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  30.77 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  33.61 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2092  TonB-like protein  27.4 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.014367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7000  hypothetical protein  33.65 
 
 		 154 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695854 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3695  TonB family protein  30.57 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  29.19 
 
 		 235 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  29.09 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  27.4 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  29.01 
 
 		 292 aa  55.5  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  21.26 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  23.21 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2159  TonB family protein  27.13 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3965  TonB family protein  28.44 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4275  TonB family protein  39.56 
 
 		 277 aa  52.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  26.04 
 
 		 220 aa  52  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2307  TonB like protein  32.14 
 
 		 263 aa  52  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.242598  normal  0.294418 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1269  TonB protein  32.14 
 
 		 263 aa  52  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111983  normal  0.123169 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2822  TonB-like  32.11 
 
 		 114 aa  51.6  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.628558  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  30.58 
 
 		 451 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2101  TonB family protein  31.58 
 
 		 171 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.483665  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  25.91 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  35 
 
 		 248 aa  49.7  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  45 
 
 		 164 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2230  energy transducer  31.71 
 
 		 315 aa  49.7  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2278  TonB family protein  38.46 
 
 		 247 aa  49.3  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.453264 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  45 
 
 		 202 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  33 
 
 		 246 aa  49.3  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3545  putative energy transducer TonB  25.85 
 
 		 269 aa  49.3  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0392  ATP-binding protein  32 
 
 		 257 aa  48.9  0.00009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.511226  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1517  TonB-like  31.25 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  26.37 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  29.67 
 
 		 219 aa  48.5  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  31.87 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  30.23 
 
 		 324 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1004  TonB-like  24.34 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  39.73 
 
 		 284 aa  46.6  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1242  protein TonB  28.69 
 
 		 283 aa  46.6  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.510655  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  31.03 
 
 		 261 aa  45.8  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3748  TonB family protein  38.81 
 
 		 88 aa  45.4  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  31.58 
 
 		 263 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2359  TonB-like  34.85 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1027  TonB, C-terminal  29.35 
 
 		 235 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1586  TonB family protein  36.92 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  35.9 
 
 		 485 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1845  TonB family protein  32.58 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2337  TonB-dependent receptor, putative  31.4 
 
 		 279 aa  43.5  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2389  TonB-dependent receptor, putative  34.02 
 
 		 245 aa  43.5  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1338  TonB-like protein  36.92 
 
 		 238 aa  43.1  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.101224 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0644  TonB-like  29.49 
 
 		 233 aa  42.4  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2127  TonB-like  31.91 
 
 		 330 aa  42.7  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0144571  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3417  TonB protein  35.04 
 
 		 178 aa  42  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0789  TonB-like protein  29.14 
 
 		 269 aa  42.4  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000813282  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2144  TonB family protein  29.09 
 
 		 296 aa  42  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  27.34 
 
 		 291 aa  42  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>