94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1982 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1982  TonB-like  100 
 
 		 266 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  66.55 
 
 		 279 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0749  TonB-like  56 
 
 		 269 aa  226  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  52.86 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  52.86 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  40.07 
 
 		 285 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  36.4 
 
 		 291 aa  109  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  35.02 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4275  TonB family protein  35.31 
 
 		 277 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  32.76 
 
 		 290 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  35.35 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  30.89 
 
 		 264 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  34.39 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  37.65 
 
 		 269 aa  96.7  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2092  TonB-like protein  31.47 
 
 		 264 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.014367 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2359  TonB-like  35.88 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  31.39 
 
 		 267 aa  92  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  31.39 
 
 		 267 aa  92  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  31.02 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3695  TonB family protein  36.1 
 
 		 282 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  34.67 
 
 		 273 aa  89  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  45.05 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  35.9 
 
 		 279 aa  86.3  4e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3965  TonB family protein  29.8 
 
 		 264 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  29.3 
 
 		 258 aa  86.3  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  46.67 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  39.56 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  36.72 
 
 		 250 aa  78.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2307  TonB like protein  33.33 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.242598  normal  0.294418 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1269  TonB protein  33.33 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111983  normal  0.123169 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  32.81 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  29.81 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  31.69 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1517  TonB-like  35.76 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3545  putative energy transducer TonB  28.29 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  27.69 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  32.79 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  28.83 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0174  TonB-dependent colicin receptor protein, putative  30.25 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4651  TonB family protein  32.7 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.340402 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  28.83 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1668  TonB-dependent receptor  30.66 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  29.56 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  33.96 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  33.96 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  33.02 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1620  TonB family protein  40.45 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.381372 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  29.95 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1133  TonB family protein  37.93 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  32.97 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  31.87 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  28.92 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2230  energy transducer  31.44 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3748  TonB family protein  42.05 
 
 		 88 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1614  TonB protein  32.59 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7000  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695854 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  38.89 
 
 		 495 aa  61.2  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  30.39 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  31.96 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0725  TonB family protein  35.94 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398336  normal  0.51938 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2101  TonB family protein  32.21 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.483665  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1616  TonB family protein  38.2 
 
 		 378 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  hitchhiker  0.00492157 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1898  TonB family protein  38.2 
 
 		 366 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3167  protein TolA  29.62 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10610  TonB protein  39.33 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.94051  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  37.23 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  41.3 
 
 		 263 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  41.1 
 
 		 411 aa  53.5  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  30.77 
 
 		 246 aa  52.4  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1256  TonB family protein  35.25 
 
 		 325 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.739127  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  33.33 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  28.49 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2512  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  34.33 
 
 		 411 aa  50.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.929963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0914  TonB family protein  35.61 
 
 		 174 aa  49.7  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  28.97 
 
 		 235 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2144  TonB family protein  34.07 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  29.7 
 
 		 219 aa  48.5  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2906  TonB-like  32 
 
 		 235 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155829  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  35.53 
 
 		 164 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0505  TonB family protein  34.96 
 
 		 169 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.481189 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1487  TonB family protein  34.85 
 
 		 386 aa  45.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.39629 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  33.01 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  35.53 
 
 		 202 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4555  TonB-like protein  33.8 
 
 		 369 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248985  normal  0.0574394 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1467  TonB family protein  40.68 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132532  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  36.11 
 
 		 261 aa  43.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  30 
 
 		 284 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3015  TonB family protein  29.33 
 
 		 443 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  25.41 
 
 		 250 aa  43.1  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0708  TonB family protein  25.5 
 
 		 256 aa  43.1  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  32.89 
 
 		 251 aa  42.7  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2822  TonB-like  31.13 
 
 		 114 aa  42.7  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.628558  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0401  TonB family protein  25.7 
 
 		 274 aa  42.4  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.236004  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0183  TonB family protein  30.91 
 
 		 251 aa  42.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.144886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>