78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2144 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2144  TonB family protein  100 
 
 		 296 aa  582  1.0000000000000001e-165  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0507  TonB family protein  51.46 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00076316 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  32.27 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  34.71 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  31.93 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  37.36 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0749  TonB-like  39.58 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0708  TonB family protein  25.67 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  34.62 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  37.66 
 
 		 248 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  37.66 
 
 		 248 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  34.78 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  34.07 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  35.23 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0451  TonB family protein  37.08 
 
 		 242 aa  54.7  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103845  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  33.33 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  39.56 
 
 		 267 aa  53.1  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  39.56 
 
 		 267 aa  53.1  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  28.14 
 
 		 324 aa  53.1  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  31.95 
 
 		 292 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  33.7 
 
 		 290 aa  52.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10610  TonB protein  37.5 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.94051  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  28.3 
 
 		 336 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  33.68 
 
 		 495 aa  51.2  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  36.84 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  39.39 
 
 		 268 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  39.39 
 
 		 268 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3111  TonB, C-terminal  42.11 
 
 		 174 aa  50.4  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  39.39 
 
 		 268 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  38.55 
 
 		 265 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  28.87 
 
 		 248 aa  50.1  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2359  TonB-like  40.62 
 
 		 278 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  34.12 
 
 		 219 aa  49.3  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  32.14 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  34.65 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  33.12 
 
 		 451 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  29.35 
 
 		 242 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  41.82 
 
 		 251 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1643  TonB family protein  31.96 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0339167  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  29.35 
 
 		 242 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  35.37 
 
 		 243 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  35.37 
 
 		 243 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  40.62 
 
 		 447 aa  46.6  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  35.37 
 
 		 243 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2153  TonB-like  34.38 
 
 		 276 aa  46.6  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.897555  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  38.67 
 
 		 270 aa  46.2  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1512  TonB family protein  41.82 
 
 		 316 aa  46.2  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0759  TonB family protein  31.52 
 
 		 314 aa  46.2  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  31.25 
 
 		 248 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1982  TonB-like  35.96 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  30.61 
 
 		 258 aa  45.8  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0808  TonB-like protein  36.71 
 
 		 217 aa  44.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.656217  hitchhiker  0.00924999 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1338  TonB-like protein  44.44 
 
 		 238 aa  44.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.101224 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  32.84 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1004  TonB-like  40 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  38.18 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2295  TonB-like  31.82 
 
 		 507 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  41.94 
 
 		 164 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  36.36 
 
 		 243 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  36.36 
 
 		 243 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2223  TonB family protein  36.36 
 
 		 226 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  36.36 
 
 		 243 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  35.04 
 
 		 264 aa  43.5  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  36.59 
 
 		 263 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  36.36 
 
 		 226 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2507  TonB-like protein  38.78 
 
 		 316 aa  43.1  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  28.85 
 
 		 411 aa  43.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  28.04 
 
 		 273 aa  43.5  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0138  TonB family protein  32.92 
 
 		 354 aa  43.1  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  41.94 
 
 		 202 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1184  TonB family protein  33.78 
 
 		 249 aa  42.7  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  30.93 
 
 		 289 aa  42.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  29.68 
 
 		 266 aa  42.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  24.6 
 
 		 267 aa  42.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  24.6 
 
 		 267 aa  42.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2268  TonB family protein  36.99 
 
 		 237 aa  42.4  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.461611  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1915  TonB family protein  36.99 
 
 		 237 aa  42.4  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  32.29 
 
 		 263 aa  42.4  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>