69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0451 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0451  TonB family protein  100 
 
 
242 aa  432  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103845  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  27.03 
 
 
268 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  27.03 
 
 
268 aa  72  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  31.08 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  33.04 
 
 
250 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  26.05 
 
 
256 aa  58.9  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0849  TonB, putative  19.32 
 
 
249 aa  56.2  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00146132  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2144  TonB family protein  37.08 
 
 
296 aa  55.5  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  29.67 
 
 
251 aa  55.5  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  24.22 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  48.48 
 
 
444 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  56.79 
 
 
268 aa  54.7  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0271  TonB-like protein  25.23 
 
 
233 aa  53.1  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  26.17 
 
 
336 aa  53.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  28.41 
 
 
324 aa  52.8  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  31.67 
 
 
248 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  29.35 
 
 
285 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  58.62 
 
 
539 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  30.23 
 
 
269 aa  51.2  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  23.26 
 
 
267 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  23.26 
 
 
267 aa  51.6  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  23.85 
 
 
267 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  37.31 
 
 
248 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  46.48 
 
 
489 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  37.5 
 
 
248 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  25 
 
 
248 aa  50.1  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  28.38 
 
 
484 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  47.46 
 
 
926 aa  49.3  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0716  TonB family protein  21.03 
 
 
212 aa  49.3  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  36.84 
 
 
289 aa  49.3  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  44 
 
 
115 aa  47  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  24.49 
 
 
220 aa  47.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0660  TonB-like protein  28 
 
 
255 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0436  hypothetical protein  54.9 
 
 
613 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  45.76 
 
 
344 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  34.07 
 
 
244 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3402  hypothetical protein  27.83 
 
 
431 aa  47.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  28.32 
 
 
292 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  25.26 
 
 
292 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  25.34 
 
 
219 aa  46.6  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2219  TonB family protein  22.11 
 
 
290 aa  46.2  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.479729  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  32.53 
 
 
265 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2159  TonB family protein  24.02 
 
 
277 aa  46.2  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  26.55 
 
 
292 aa  46.2  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  23.7 
 
 
242 aa  45.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  23.7 
 
 
242 aa  45.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  42.37 
 
 
630 aa  45.4  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  27.85 
 
 
292 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1434  hypothetical protein  27.66 
 
 
772 aa  45.4  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.709183  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  23.84 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0937  TonB family protein  28.43 
 
 
288 aa  44.7  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164985  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1988  group-specific protein  28.57 
 
 
928 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  26.32 
 
 
228 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0695  TonB family protein  30.38 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.773203  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0694  TonB family protein  30.38 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335594  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1621  TonB-dependent receptor, putative, authentic frameshift  23.4 
 
 
227 aa  43.1  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614853  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0459  hypothetical protein  54.9 
 
 
611 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0872017  normal  0.526818 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0183  TonB family protein  28.99 
 
 
251 aa  43.5  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.144886  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0449  hypothetical protein  54.9 
 
 
611 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00263959  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  34.21 
 
 
522 aa  43.5  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  35.38 
 
 
991 aa  43.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  32.56 
 
 
239 aa  43.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1004  TonB-like  20.98 
 
 
239 aa  43.1  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1487  TonB family protein  23.4 
 
 
386 aa  42.7  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.39629 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8424  protein of unknown function DUF470  37.14 
 
 
701 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  40.28 
 
 
1261 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  46.58 
 
 
423 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  26.63 
 
 
286 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0858  TonB-dependent receptor, putative  24.7 
 
 
293 aa  41.6  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00190793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>