20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0858 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0858  TonB-dependent receptor, putative  100 
 
 		 293 aa  587  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00190793  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1158  TonB-like  68.98 
 
 		 297 aa  359  4e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000294867  decreased coverage  0.0031097 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1173  TonB family protein  52.58 
 
 		 282 aa  301  6.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.140977  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1499  TonB family protein  48.96 
 
 		 281 aa  242  6e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0204221  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2801  TonB family protein  45.57 
 
 		 282 aa  237  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2891  TonB family protein  54.67 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2717  TonB family protein  46.69 
 
 		 281 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2541  periplasmic protein TonB  30.98 
 
 		 272 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.70786e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2576  TonB-like protein  31.53 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0854385 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1845  TonB family protein  37.31 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  34.94 
 
 		 243 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  34.94 
 
 		 243 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  34.94 
 
 		 243 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3297  TonB family protein  29.91 
 
 		 470 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.158532  normal  0.575713 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2626  TonB family protein  26.36 
 
 		 419 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0401  TonB family protein  38 
 
 		 274 aa  43.1  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.236004  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2720  TonB family protein  26.36 
 
 		 419 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0689  S-adenosylmethionine synthetase  33.8 
 
 		 460 aa  42.7  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.918413 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3679  TonB family protein  26.19 
 
 		 307 aa  42.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  33.73 
 
 		 244 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>