107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1845 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1845  TonB family protein  100 
 
 		 268 aa  479  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  30.18 
 
 		 268 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  30.82 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  29.24 
 
 		 268 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  48.35 
 
 		 250 aa  87  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  40.91 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  65.91 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  50 
 
 		 926 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  49.35 
 
 		 444 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  32.43 
 
 		 489 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  36.96 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  37.1 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  48.05 
 
 		 484 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  37.5 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  42.5 
 
 		 630 aa  63.9  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  39.53 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  27.4 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  36.51 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1988  group-specific protein  29.11 
 
 		 928 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  24.51 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  26.94 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  26.94 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  34.48 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  38.38 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  40.79 
 
 		 1261 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  33.71 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  37.35 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1850  putative tonB protein  29.87 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.473086  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  35.23 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  29.17 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  32.26 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2065  TonB family protein  33.33 
 
 		 201 aa  53.9  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  35.56 
 
 		 235 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  43.04 
 
 		 344 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3267  hypothetical protein  27.27 
 
 		 537 aa  53.1  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  35.96 
 
 		 522 aa  53.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  29.46 
 
 		 292 aa  52.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23491  hypothetical protein  45.88 
 
 		 480 aa  52  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.425384 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.17 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  37.18 
 
 		 897 aa  50.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  45.12 
 
 		 539 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2359  TonB-like  35.23 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  44.23 
 
 		 2313 aa  50.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  32.47 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1469  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  26.74 
 
 		 445 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0854841  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3965  TonB family protein  35.23 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3111  TonB, C-terminal  38.46 
 
 		 174 aa  50.4  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2906  TonB-like  34.21 
 
 		 235 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155829  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  30.23 
 
 		 308 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  29.03 
 
 		 267 aa  50.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  29.03 
 
 		 267 aa  50.4  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  29.03 
 
 		 267 aa  50.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  24.72 
 
 		 264 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  23.67 
 
 		 288 aa  50.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1621  TonB-dependent receptor, putative, authentic frameshift  29.55 
 
 		 227 aa  50.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614853  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3858  rhs element Vgr protein  45.45 
 
 		 258 aa  50.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2101  TonB family protein  36.36 
 
 		 171 aa  49.7  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.483665  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  31.43 
 
 		 251 aa  50.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  18.55 
 
 		 279 aa  49.7  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  31.53 
 
 		 489 aa  49.3  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  34.29 
 
 		 332 aa  48.9  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2092  TonB-like protein  34.09 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.014367 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  29.03 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  32.53 
 
 		 991 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0436  hypothetical protein  51.72 
 
 		 613 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  28.16 
 
 		 830 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  24.59 
 
 		 324 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.49 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2389  TonB-dependent receptor, putative  32.61 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0449  hypothetical protein  52.63 
 
 		 611 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00263959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0459  hypothetical protein  52.63 
 
 		 611 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0872017  normal  0.526818 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2801  TonB family protein  23.14 
 
 		 282 aa  47  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  31.82 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0789  TonB-like protein  34.18 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000813282  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  31.58 
 
 		 252 aa  46.6  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  29.03 
 
 		 219 aa  46.6  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  34.62 
 
 		 407 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1296  peptidase S11 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase 1  32.8 
 
 		 550 aa  46.2  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.354374  normal  0.606221 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2159  TonB family protein  23.79 
 
 		 277 aa  45.8  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8424  protein of unknown function DUF470  35.62 
 
 		 701 aa  45.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1487  TonB family protein  24.74 
 
 		 386 aa  45.8  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.39629 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  37.5 
 
 		 453 aa  45.8  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0858  TonB-dependent receptor, putative  29.01 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00190793  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2374  glycosy hydrolase family protein  33.33 
 
 		 535 aa  44.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22510  hypothetical protein  50 
 
 		 608 aa  45.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.818778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  24.42 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0063  peptidoglycan-binding LysM  34.06 
 
 		 202 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0180593  normal  0.117773 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  36.59 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1499  TonB family protein  38.46 
 
 		 281 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0204221  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  34.85 
 
 		 433 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  25.64 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2717  TonB family protein  38.46 
 
 		 281 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1434  hypothetical protein  24 
 
 		 772 aa  43.5  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.709183  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  23.6 
 
 		 250 aa  43.5  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1651  protein TonB  22.98 
 
 		 241 aa  43.5  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.350866  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4621  hypothetical protein  35 
 
 		 481 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.957856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1573  hypothetical protein  29.82 
 
 		 1197 aa  43.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.275879  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1173  TonB family protein  32.84 
 
 		 282 aa  43.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.140977  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3402  hypothetical protein  25.93 
 
 		 431 aa  42.7  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  24.72 
 
 		 239 aa  42.7  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>