40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2717 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2717  TonB family protein  100 
 
 		 281 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1499  TonB family protein  94.66 
 
 		 281 aa  512  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0204221  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1173  TonB family protein  55.36 
 
 		 282 aa  291  6e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.140977  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1158  TonB-like  52.9 
 
 		 297 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000294867  decreased coverage  0.0031097 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2801  TonB family protein  48.81 
 
 		 282 aa  249  4e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0858  TonB-dependent receptor, putative  49.31 
 
 		 293 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00190793  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2891  TonB family protein  49.82 
 
 		 283 aa  225  7e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2541  periplasmic protein TonB  36.8 
 
 		 272 aa  94  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.70786e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2626  TonB family protein  30.24 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2720  TonB family protein  31.39 
 
 		 419 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1239  TonB-like protein  29.93 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.234262  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  25.93 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2576  TonB-like protein  25.24 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0854385 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  22.79 
 
 		 288 aa  53.1  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  22.08 
 
 		 300 aa  50.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  26.58 
 
 		 310 aa  49.3  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  22.86 
 
 		 251 aa  49.3  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3297  TonB family protein  26.47 
 
 		 470 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.158532  normal  0.575713 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1027  TonB, C-terminal  29.73 
 
 		 235 aa  47.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2507  TonB-like protein  29.55 
 
 		 316 aa  45.8  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  40.38 
 
 		 252 aa  45.8  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  33.33 
 
 		 411 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0183  TonB family protein  33.33 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.144886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0936  TonB family protein  30.68 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3636  hypothetical protein  29.07 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  32.43 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  26.63 
 
 		 298 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2960  hypothetical protein  40 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.999469 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0466  TonB domain protein  23.78 
 
 		 217 aa  43.9  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2528  TonB family protein  25.37 
 
 		 393 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.962714 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  30.14 
 
 		 285 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1845  TonB family protein  38.46 
 
 		 268 aa  43.5  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4324  TonB family protein  30.34 
 
 		 286 aa  43.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  25.85 
 
 		 324 aa  43.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1323  hypothetical protein  38.18 
 
 		 245 aa  42.7  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.329029  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  29.76 
 
 		 251 aa  42.7  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3679  TonB family protein  24.59 
 
 		 307 aa  42.7  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3111  TonB, C-terminal  34.33 
 
 		 174 aa  42.7  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  28 
 
 		 237 aa  42  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  32 
 
 		 250 aa  42  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>