51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1173 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1173  TonB family protein  100 
 
 		 282 aa  566  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.140977  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1158  TonB-like  54.45 
 
 		 297 aa  296  3e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000294867  decreased coverage  0.0031097 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0858  TonB-dependent receptor, putative  52.58 
 
 		 293 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00190793  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1499  TonB family protein  55.63 
 
 		 281 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0204221  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2717  TonB family protein  54.8 
 
 		 281 aa  268  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2801  TonB family protein  50.53 
 
 		 282 aa  261  8e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2891  TonB family protein  51.77 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2541  periplasmic protein TonB  30.28 
 
 		 272 aa  112  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.70786e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  23.76 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  27.57 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2626  TonB family protein  24.46 
 
 		 419 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2720  TonB family protein  24.46 
 
 		 419 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  26.88 
 
 		 285 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  30 
 
 		 308 aa  49.3  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  28.57 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1239  TonB-like protein  23.74 
 
 		 431 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.234262  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0401  TonB family protein  36.49 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.236004  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  25.81 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1571  TonB family protein  55.56 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.265243 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0466  TonB domain protein  22.29 
 
 		 217 aa  46.6  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  24.34 
 
 		 298 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  32.53 
 
 		 243 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  32.53 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  32.53 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  24.67 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  26.97 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  28.75 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0936  TonB family protein  28.87 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  21.4 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  21.4 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  36.67 
 
 		 495 aa  44.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1512  TonB family protein  39.58 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  26.83 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  25.97 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  26.26 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5036  tonB domain protein  22.35 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3111  TonB, C-terminal  30.99 
 
 		 174 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2576  TonB-like protein  24.82 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0854385 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  26.87 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  24.84 
 
 		 273 aa  43.9  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  28.99 
 
 		 263 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3908  TonB, C-terminal  28.77 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1845  TonB family protein  32.84 
 
 		 268 aa  43.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  21.05 
 
 		 300 aa  43.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  30.26 
 
 		 289 aa  42.7  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  38.46 
 
 		 251 aa  42.7  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2507  TonB-like protein  26.24 
 
 		 316 aa  42.7  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1004  TonB-like  27.12 
 
 		 239 aa  42.4  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3297  TonB family protein  25 
 
 		 470 aa  42.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.158532  normal  0.575713 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  27.72 
 
 		 292 aa  42  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1323  hypothetical protein  42.31 
 
 		 245 aa  42  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.329029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>