60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1158 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1158  TonB-like  100 
 
 		 297 aa  587  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000294867  decreased coverage  0.0031097 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0858  TonB-dependent receptor, putative  68.98 
 
 		 293 aa  360  1e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00190793  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1173  TonB family protein  54.45 
 
 		 282 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.140977  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1499  TonB family protein  52.56 
 
 		 281 aa  264  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0204221  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2801  TonB family protein  49.66 
 
 		 282 aa  260  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2891  TonB family protein  52.94 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2717  TonB family protein  50.34 
 
 		 281 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2541  periplasmic protein TonB  33.74 
 
 		 272 aa  99.8  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.70786e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  38.64 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2626  TonB family protein  31.03 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2720  TonB family protein  31.03 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  25.84 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  23.95 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  33.33 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1239  TonB-like protein  29.31 
 
 		 431 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.234262  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3297  TonB family protein  29.41 
 
 		 470 aa  52.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.158532  normal  0.575713 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  36.67 
 
 		 308 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  25.53 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  32.97 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2576  TonB-like protein  29.03 
 
 		 294 aa  50.4  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0854385 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3679  TonB family protein  26.72 
 
 		 307 aa  50.1  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  25.89 
 
 		 324 aa  49.7  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  24.34 
 
 		 292 aa  49.3  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  25.27 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  24.79 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  24.73 
 
 		 291 aa  47  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  24.73 
 
 		 291 aa  47  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  30.38 
 
 		 298 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3636  hypothetical protein  31.58 
 
 		 294 aa  45.8  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  25.81 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5044  TonB family protein  24.71 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.805089  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4994  TonB family protein  36.07 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4868  TonB family protein  36.07 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5036  tonB domain protein  31.25 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0486  TonB, C-terminal  31.25 
 
 		 300 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.544308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5310  TonB-like  31.25 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0148466  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4324  TonB family protein  28.85 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2507  TonB-like protein  24.6 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  25.25 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  25.81 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  31.25 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0466  TonB domain protein  21.71 
 
 		 217 aa  45.1  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0401  TonB family protein  38.18 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.236004  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  31.25 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  30.77 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1845  TonB family protein  34.33 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  31.25 
 
 		 243 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1571  TonB family protein  53.33 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.265243 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03160  TonB protein  32.79 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.444555  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0183  TonB family protein  35 
 
 		 251 aa  44.3  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.144886  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  31.11 
 
 		 284 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  27.66 
 
 		 273 aa  43.5  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  24.06 
 
 		 256 aa  43.5  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  27.66 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  31.94 
 
 		 295 aa  43.5  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0842  TonB family protein  30.26 
 
 		 286 aa  43.1  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1323  hypothetical protein  29.52 
 
 		 245 aa  42.7  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.329029  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2295  TonB-like  44 
 
 		 507 aa  42.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3111  TonB, C-terminal  37.04 
 
 		 174 aa  42.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2337  TonB-dependent receptor, putative  20.95 
 
 		 279 aa  42.4  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>