42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1571 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1571  TonB family protein  100 
 
 		 251 aa  468  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.265243 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  33.67 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1807  TonB family protein  47.89 
 
 		 233 aa  67  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.390031  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  36.49 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  30.46 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  30.46 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  50.91 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  44.29 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  37.5 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  50.91 
 
 		 231 aa  53.1  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  34.88 
 
 		 237 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3718  periplasmic protein/ biopolymer transport  55.32 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  38.16 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  31.43 
 
 		 2179 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  39.71 
 
 		 1281 aa  50.1  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  33.33 
 
 		 223 aa  48.9  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  41.1 
 
 		 244 aa  48.9  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  34.94 
 
 		 243 aa  48.9  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  31.9 
 
 		 242 aa  48.5  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  31.9 
 
 		 242 aa  48.5  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  39.68 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1664  TonB/TolA energy transducing protein  30.77 
 
 		 337 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0106366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  34.94 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  36.49 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1906  TonB-like  32.89 
 
 		 334 aa  47  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.338738  normal  0.207358 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1158  TonB-like  49.02 
 
 		 297 aa  45.8  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000294867  decreased coverage  0.0031097 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  36.51 
 
 		 249 aa  45.8  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  42.86 
 
 		 117 aa  45.8  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  53.33 
 
 		 239 aa  45.4  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  35.8 
 
 		 277 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1242  protein TonB  32.86 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.510655  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  34.67 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  36.49 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  29.94 
 
 		 271 aa  43.5  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  30.47 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3773  TonB family protein  41.51 
 
 		 475 aa  42.7  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.854647  normal  0.705204 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  47.83 
 
 		 251 aa  42.4  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1149  TonB family protein  32 
 
 		 293 aa  42.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  35.14 
 
 		 259 aa  42  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  33.73 
 
 		 276 aa  42  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  32.2 
 
 		 243 aa  42  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  35.62 
 
 		 280 aa  42  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>