136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2405 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  100 
 
 		 310 aa  601  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  44.1 
 
 		 292 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0937  TonB family protein  42.95 
 
 		 288 aa  157  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164985  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  36.62 
 
 		 288 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2337  TonB-dependent receptor, putative  46.38 
 
 		 279 aa  146  5e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  38.01 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5044  TonB family protein  36.3 
 
 		 301 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.805089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  33.68 
 
 		 297 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4994  TonB family protein  34.8 
 
 		 301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  33.78 
 
 		 319 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4868  TonB family protein  34.46 
 
 		 301 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4324  TonB family protein  34.86 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  34.72 
 
 		 294 aa  132  7.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  35.15 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3636  hypothetical protein  30.62 
 
 		 294 aa  129  8.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2507  TonB-like protein  33.77 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  32.2 
 
 		 291 aa  127  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  32.2 
 
 		 291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  37.72 
 
 		 295 aa  125  9e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  54.55 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5036  tonB domain protein  33.1 
 
 		 297 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0486  TonB, C-terminal  32.88 
 
 		 300 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.544308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2576  TonB-like protein  58 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0854385 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3679  TonB family protein  33.9 
 
 		 307 aa  115  8.999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5310  TonB-like  34.44 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0148466  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03160  TonB protein  49.59 
 
 		 297 aa  113  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.444555  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01600  TonB protein  29.93 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0537  TonB-like  33.11 
 
 		 333 aa  106  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0510  TonB family protein  33.16 
 
 		 250 aa  103  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3908  TonB, C-terminal  30.2 
 
 		 296 aa  90.1  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3406  TonB family protein  37.27 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1978  TonB family protein  31.18 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.284174  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1646  TonB family protein  31.18 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0972936  hitchhiker  0.00122452 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0624  hypothetical protein  25.33 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1088  TonB-like  28.94 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.764781  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3200  periplasmic protein/ biopolymer transport  31.9 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.917881  normal  0.0459006 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3981  TonB family protein  39.82 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000313556 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0588  TonB-like  25.33 
 
 		 323 aa  75.9  0.0000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0936  TonB family protein  34.51 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0842  TonB family protein  35.4 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3412  TonB-like  35.59 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1483  TonB family protein  33.62 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00129671  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2778  hypothetical protein  34.68 
 
 		 304 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.241997 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3655  TonB family protein  33.63 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2612  TonB family protein  33.06 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3022  TonB family protein  33.06 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.364821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2196  TonB family protein  33.63 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2711  GETHR pentapeptide  34.78 
 
 		 654 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.653885  hitchhiker  0.000850272 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2965  TonB family protein  33.63 
 
 		 286 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2856  TonB, C-terminal  34.15 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3055  TonB-like protein  25.66 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.719984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  30.57 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0216  TonB family protein  30.6 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  30.94 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  40.54 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  45.61 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  29.02 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1004  TonB-like  39.22 
 
 		 239 aa  55.5  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2275  TonB family protein  38.16 
 
 		 242 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1922  TonB family protein  38.16 
 
 		 208 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2668  TonB family protein  36 
 
 		 252 aa  53.9  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  29.68 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  41.07 
 
 		 308 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2230  energy transducer  34.07 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  42.59 
 
 		 248 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  42.59 
 
 		 248 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2717  TonB family protein  26.58 
 
 		 281 aa  50.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1499  TonB family protein  26.32 
 
 		 281 aa  50.4  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0204221  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  38.98 
 
 		 244 aa  50.4  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  42.86 
 
 		 280 aa  50.1  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1915  TonB family protein  34.02 
 
 		 237 aa  49.7  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2268  TonB family protein  34.02 
 
 		 237 aa  49.7  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.461611  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2127  TonB-like  36.49 
 
 		 330 aa  49.7  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0144571  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2891  TonB family protein  27.27 
 
 		 283 aa  49.7  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  38.89 
 
 		 263 aa  48.9  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  30.77 
 
 		 256 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1158  TonB-like  24.79 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000294867  decreased coverage  0.0031097 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  43.1 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0730  TonB-like  32.56 
 
 		 225 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.210175  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  28.77 
 
 		 451 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  32.61 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0965  TonB family protein  44 
 
 		 283 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0296  TonB family protein  34.62 
 
 		 192 aa  47.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.501674  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3670  TonB1 protein  42.86 
 
 		 274 aa  47.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2389  TonB-dependent receptor, putative  30.15 
 
 		 245 aa  47.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  48.89 
 
 		 288 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  30.77 
 
 		 286 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3236  TonB family protein  37.88 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00481831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  40.35 
 
 		 252 aa  47.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2689  TonB family protein  31.52 
 
 		 264 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2313  hypothetical protein  31.52 
 
 		 264 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.8827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  46.94 
 
 		 287 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0951  TonB family protein  38.38 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00168123  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  41.82 
 
 		 236 aa  46.6  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0789  TonB-like protein  41.18 
 
 		 269 aa  46.6  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000813282  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  35.71 
 
 		 269 aa  46.2  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0401  TonB family protein  31.51 
 
 		 274 aa  46.2  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.236004  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  41.27 
 
 		 245 aa  46.2  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  47.06 
 
 		 441 aa  45.8  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0017  TonB-like  42.11 
 
 		 220 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>