55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1922 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2275  TonB family protein  100 
 
 		 242 aa  392  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1922  TonB family protein  100 
 
 		 208 aa  390  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2268  TonB family protein  54.72 
 
 		 237 aa  135  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.461611  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1915  TonB family protein  54.72 
 
 		 237 aa  135  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0296  TonB family protein  45.83 
 
 		 192 aa  90.5  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.501674  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0770  TonB family protein  38.17 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0913  TonB family protein  38.17 
 
 		 252 aa  90.5  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  31.94 
 
 		 242 aa  72  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  31.94 
 
 		 242 aa  72  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1184  TonB family protein  57.14 
 
 		 249 aa  71.6  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  28.73 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  37.37 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  35.29 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2530  LytB protein  37.63 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000152154  normal  0.947452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  37.78 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2389  TonB-dependent receptor, putative  41.56 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2065  TonB family protein  27.01 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  36.64 
 
 		 289 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  31.18 
 
 		 324 aa  51.6  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  38.71 
 
 		 269 aa  51.6  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  30 
 
 		 286 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  26.67 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  34.41 
 
 		 263 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  36.51 
 
 		 250 aa  48.5  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3167  protein TolA  39.73 
 
 		 331 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  28.3 
 
 		 451 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  36.36 
 
 		 267 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  36.36 
 
 		 267 aa  46.6  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  36.36 
 
 		 267 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0886  hypothetical protein  39.02 
 
 		 2113 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1586  TonB family protein  34.69 
 
 		 276 aa  46.2  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  28.57 
 
 		 246 aa  46.2  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  29.03 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3236  TonB family protein  36.21 
 
 		 291 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00481831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  31.03 
 
 		 243 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3748  TonB family protein  36.99 
 
 		 88 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  36.49 
 
 		 264 aa  44.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  32.18 
 
 		 284 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  26.37 
 
 		 292 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  31.82 
 
 		 317 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1616  TonB family protein  40.62 
 
 		 378 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  hitchhiker  0.00492157 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1898  TonB family protein  40.62 
 
 		 366 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  27.78 
 
 		 290 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03102  hypothetical protein  37.84 
 
 		 1482 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  29.89 
 
 		 243 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0660  TonB-like protein  30 
 
 		 255 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  29.89 
 
 		 243 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  21.71 
 
 		 336 aa  42.4  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0794  TonB, C-terminal  51.35 
 
 		 378 aa  42.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  34.18 
 
 		 292 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2359  TonB-like  36.51 
 
 		 278 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  34.72 
 
 		 291 aa  41.6  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7000  hypothetical protein  31.65 
 
 		 154 aa  41.6  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695854 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  29.23 
 
 		 256 aa  41.2  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1668  TonB-dependent receptor  36.07 
 
 		 308 aa  41.2  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>