33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2268 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1915  TonB family protein  100 
 
 
237 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2268  TonB family protein  100 
 
 
237 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.461611  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2275  TonB family protein  49.13 
 
 
242 aa  148  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1922  TonB family protein  47.42 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0923721  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0296  TonB family protein  43.15 
 
 
192 aa  89.4  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.501674  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0913  TonB family protein  29.96 
 
 
252 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0770  TonB family protein  29.96 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  28.98 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  28.98 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1184  TonB family protein  46.58 
 
 
249 aa  72  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2389  TonB-dependent receptor, putative  41.25 
 
 
245 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2906  TonB-like  28.5 
 
 
235 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155829  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3002  TonB family protein  30.85 
 
 
231 aa  52.4  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2612  hypothetical protein  30.85 
 
 
231 aa  52.4  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  29.79 
 
 
286 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  31.18 
 
 
284 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  34.02 
 
 
310 aa  49.7  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  26.95 
 
 
219 aa  48.1  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2530  LytB protein  38.2 
 
 
253 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000152154  normal  0.947452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  30.77 
 
 
285 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  20.36 
 
 
248 aa  47  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  28.44 
 
 
292 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  26.67 
 
 
251 aa  45.4  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2065  TonB family protein  26.51 
 
 
201 aa  44.7  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  29.63 
 
 
289 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0507  TonB family protein  38.89 
 
 
272 aa  43.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00076316 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  30.47 
 
 
1888 aa  43.1  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1175  hypothetical protein  48.98 
 
 
208 aa  42.7  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2144  TonB family protein  36.99 
 
 
296 aa  42.4  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  41.82 
 
 
1281 aa  42.4  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  26.11 
 
 
268 aa  42  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  26.32 
 
 
290 aa  41.6  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  35.29 
 
 
264 aa  41.6  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>