195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1564 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  100 
 
 		 219 aa  433  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  32.69 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  40 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  35.11 
 
 		 263 aa  62  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2159  TonB family protein  30.77 
 
 		 277 aa  62  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  34.83 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  34.44 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1368  TonB family protein  38.46 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  35.05 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  32.22 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  35.96 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2389  TonB-dependent receptor, putative  38.03 
 
 		 245 aa  58.2  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  33.93 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  35.62 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  35.62 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0392  ATP-binding protein  38.16 
 
 		 257 aa  57  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.511226  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  32.77 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  30 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  32.77 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  32.22 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  29.91 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2153  TonB-like  30.91 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.897555  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  29.91 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  29.91 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2065  TonB family protein  36.26 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  32.22 
 
 		 292 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  29.9 
 
 		 336 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  34.13 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  44.64 
 
 		 244 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  32.58 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  43.04 
 
 		 252 aa  53.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2530  LytB protein  33.01 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000152154  normal  0.947452 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  31.71 
 
 		 265 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  40 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1242  protein TonB  34.57 
 
 		 283 aa  53.5  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.510655  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  40 
 
 		 164 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1801  putative TonB protein  41.33 
 
 		 229 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613166  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1932  siderophore-mediated iron transport protein  41.33 
 
 		 229 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  34.83 
 
 		 495 aa  53.5  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  41.33 
 
 		 246 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  41.33 
 
 		 246 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  40.26 
 
 		 248 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  41.33 
 
 		 248 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  41.33 
 
 		 246 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1621  TonB-dependent receptor, putative, authentic frameshift  28.3 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614853  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  32.08 
 
 		 246 aa  52.4  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  32.97 
 
 		 258 aa  52.4  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  32.61 
 
 		 251 aa  52.4  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  28.89 
 
 		 292 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  43.1 
 
 		 245 aa  52.4  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  29.48 
 
 		 273 aa  52  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  32.95 
 
 		 285 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3748  TonB family protein  42.03 
 
 		 88 aa  52  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  31.87 
 
 		 268 aa  51.6  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  31.94 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  37.33 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  31.46 
 
 		 267 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  31.46 
 
 		 267 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1566  TonB family protein  30.09 
 
 		 251 aa  50.8  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  31.87 
 
 		 268 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  32.93 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  36.26 
 
 		 292 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  26.4 
 
 		 324 aa  50.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0138  TonB family protein  38.03 
 
 		 354 aa  51.2  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0761  TonB family protein  44.9 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.988659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0922  putative TonB protein  34.78 
 
 		 294 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.702209  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0815  TonB family protein  38.71 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2512  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  31.11 
 
 		 411 aa  50.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.929963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1922  TonB family protein  37.1 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  38.67 
 
 		 259 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2359  TonB-like  36.92 
 
 		 278 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1467  TonB family protein  27.78 
 
 		 265 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132532  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  30 
 
 		 261 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2275  TonB family protein  37.1 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4259  TonB family protein  30.38 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2528  TonB family protein  32.94 
 
 		 393 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.962714 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  48.98 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  34.18 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  36.36 
 
 		 244 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  30.77 
 
 		 268 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0749  TonB-like  32.95 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0708  TonB family protein  27.62 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  39.47 
 
 		 117 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3167  protein TolA  42.19 
 
 		 331 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4005  TonB family protein  39.74 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  28.31 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  38.46 
 
 		 256 aa  49.7  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  35.23 
 
 		 451 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  30.19 
 
 		 193 aa  49.3  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2994  TonB family protein  42.86 
 
 		 294 aa  48.9  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.7532  normal  0.152882 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  36.07 
 
 		 280 aa  48.9  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  35.23 
 
 		 279 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  27.93 
 
 		 244 aa  48.9  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  29.27 
 
 		 251 aa  48.9  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2581  TonB family protein  35.56 
 
 		 294 aa  48.9  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.632604  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  32.91 
 
 		 248 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  34.18 
 
 		 244 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1620  TonB family protein  41.94 
 
 		 394 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.381372 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  32.89 
 
 		 308 aa  48.5  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  32.91 
 
 		 248 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>