180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0713 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  100 
 
 		 280 aa  521  1e-147  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  39.82 
 
 		 212 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  47.41 
 
 		 288 aa  99.4  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  54.37 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  44.23 
 
 		 287 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  55.68 
 
 		 253 aa  96.7  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  46.15 
 
 		 233 aa  92.4  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  46.15 
 
 		 233 aa  90.1  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  46.15 
 
 		 233 aa  89.7  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  47.78 
 
 		 232 aa  89.7  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  44.44 
 
 		 248 aa  88.2  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  45.56 
 
 		 234 aa  88.2  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  46.67 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  48.86 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  51.16 
 
 		 228 aa  85.5  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  42.22 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  44.83 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  44.83 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  36.98 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  42.05 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  43.9 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  34.1 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  35.25 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  39.78 
 
 		 117 aa  71.6  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  46.07 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  36 
 
 		 2449 aa  70.1  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  42.22 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  41.38 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  41.38 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  39.8 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  47.44 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  43.02 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  39.53 
 
 		 269 aa  67  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  43.75 
 
 		 390 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  43.02 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  42.86 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  42.5 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  30.86 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  37.5 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0184  TonB family protein  41.43 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140188 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  36.67 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  29.03 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  41.11 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  30.63 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5227  TonB family protein  43.68 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.631844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0295  TonB family protein  43.68 
 
 		 264 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14734 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  37.97 
 
 		 243 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  40 
 
 		 223 aa  62  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  24.88 
 
 		 220 aa  62  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  39.53 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  40 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  39.53 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  40 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  46.75 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  38.75 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  32.26 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  30.35 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  33.63 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  32.46 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  37.97 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  33.63 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  35.44 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  31.41 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  38.16 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  37.97 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  37.65 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  33.33 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1807  TonB family protein  38.37 
 
 		 233 aa  58.9  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.390031  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  33.61 
 
 		 218 aa  58.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0815  TonB family protein  40.62 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3718  periplasmic protein/ biopolymer transport  36.05 
 
 		 238 aa  58.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  36.71 
 
 		 245 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0674  tonB domain protein  41.86 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1149  TonB family protein  36.25 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2223  TonB family protein  36.71 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0876  TonB-like protein  38.37 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000261877  normal  0.0876537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1020  TonB-like protein  38.37 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000273603  normal  0.0339055 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  41.03 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  36.71 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  36.71 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  36.71 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1141  TonB family protein  30.39 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  37.65 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0753  TonB family protein  32.56 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.553846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3236  TonB family protein  39.02 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00481831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  36.71 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0965  TonB family protein  40.24 
 
 		 283 aa  57  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1801  putative TonB protein  36.71 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613166  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1932  siderophore-mediated iron transport protein  36.71 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  36.71 
 
 		 246 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  36.71 
 
 		 246 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  36.71 
 
 		 246 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  36.71 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3670  TonB1 protein  40.24 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  30.24 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  43.28 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0789  TonB-like protein  40.74 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000813282  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4005  TonB family protein  39.51 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  35.63 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  26.97 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>