181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1049 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  100 
 
 
223 aa  435  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  45.25 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  30.09 
 
 
212 aa  84.7  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  34.18 
 
 
256 aa  82  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  46.67 
 
 
248 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  46.67 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  46.67 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  46.67 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  46.67 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1801  putative TonB protein  46.67 
 
 
229 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613166  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1932  siderophore-mediated iron transport protein  46.67 
 
 
229 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  49.44 
 
 
233 aa  79.3  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  46.67 
 
 
244 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2277  TonB-like protein  49.35 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380607  normal  0.0262675 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  49.44 
 
 
233 aa  79  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  48.84 
 
 
232 aa  75.9  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  50 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  40.51 
 
 
245 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  41.56 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  46.15 
 
 
234 aa  72.4  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  43.53 
 
 
228 aa  72  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  39.33 
 
 
244 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  37.63 
 
 
243 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  39.5 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  39.5 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  38.96 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  43.59 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  39.33 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  41.77 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  38.96 
 
 
226 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  38.2 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  38.96 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  38.96 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2223  TonB family protein  38.96 
 
 
226 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534609  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  45.57 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  31.9 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2235  TonB, C-terminal  48.72 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361758  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1807  TonB family protein  39.74 
 
 
233 aa  65.5  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.390031  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  43.75 
 
 
253 aa  65.1  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  39.18 
 
 
269 aa  65.1  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  42.17 
 
 
276 aa  64.7  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2475  TonB like protein  40.26 
 
 
230 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  33.12 
 
 
193 aa  63.5  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1963  TONB transmembrane protein  32.32 
 
 
221 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  40.96 
 
 
208 aa  62.8  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  40 
 
 
280 aa  62.4  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0876  TonB-like protein  38.82 
 
 
275 aa  62  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000261877  normal  0.0876537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1020  TonB-like protein  38.82 
 
 
275 aa  62  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000273603  normal  0.0339055 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  42.86 
 
 
236 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  41.03 
 
 
117 aa  62  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  28.93 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  36.15 
 
 
287 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  35.19 
 
 
271 aa  60.5  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1149  TonB family protein  35.12 
 
 
293 aa  60.1  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  39.17 
 
 
218 aa  59.7  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  42.31 
 
 
266 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  42.31 
 
 
266 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  35.53 
 
 
289 aa  58.9  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  34.94 
 
 
288 aa  59.3  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  37.66 
 
 
274 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  42.31 
 
 
273 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  37.35 
 
 
237 aa  58.5  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  36.36 
 
 
273 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1141  TonB family protein  41.33 
 
 
234 aa  57.8  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  30.52 
 
 
248 aa  57  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0456  TonB-like  40 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00460811  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  33.33 
 
 
242 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0753  TonB family protein  43.75 
 
 
230 aa  57.4  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.553846  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  33.33 
 
 
242 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2116  TonB family protein  28.57 
 
 
218 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223061  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  27.1 
 
 
203 aa  55.8  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1792  TonB family protein  35.35 
 
 
218 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.433494 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2295  TonB-like  36.05 
 
 
507 aa  55.8  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459858  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  26.94 
 
 
203 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  37.18 
 
 
237 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0789  TonB-like protein  31.43 
 
 
269 aa  55.5  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000813282  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  38.46 
 
 
249 aa  55.1  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  33.33 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  38.96 
 
 
283 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  39.74 
 
 
285 aa  54.3  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01076  TonB protein  44 
 
 
219 aa  53.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147824  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06243  TonB protein  44 
 
 
219 aa  53.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.442028  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  26.48 
 
 
203 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  37.04 
 
 
267 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  40.51 
 
 
286 aa  53.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  31.21 
 
 
218 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  40.51 
 
 
275 aa  53.9  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0815  TonB family protein  43.21 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  40.51 
 
 
274 aa  54.3  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0184  TonB family protein  42.03 
 
 
267 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.140188 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  37.66 
 
 
275 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  35.56 
 
 
349 aa  52.8  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1840  TonB family protein  35.71 
 
 
138 aa  52.4  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.259302 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  25.23 
 
 
203 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  34.62 
 
 
2449 aa  52.4  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  34.18 
 
 
285 aa  52  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4005  TonB family protein  40.74 
 
 
248 aa  52  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1053  TonB family protein  44.44 
 
 
289 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0250994  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  36.84 
 
 
121 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  26.73 
 
 
203 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>