91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1963 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1963  TONB transmembrane protein  100 
 
 		 221 aa  424  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1792  TonB family protein  66.52 
 
 		 218 aa  213  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.433494 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2116  TonB family protein  66.97 
 
 		 218 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2277  TonB-like protein  42.53 
 
 		 219 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380607  normal  0.0262675 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2235  TonB, C-terminal  43.05 
 
 		 218 aa  92.8  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361758  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  38.96 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  30.14 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  39.77 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  39.53 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  38.54 
 
 		 243 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  39.53 
 
 		 248 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1932  siderophore-mediated iron transport protein  39.53 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1801  putative TonB protein  39.53 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613166  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  39.53 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  39.53 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  39.53 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1807  TonB family protein  35.02 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.390031  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  38.37 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  36.05 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  36.05 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  36.05 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2223  TonB family protein  36.05 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  36.05 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  36.05 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  34.83 
 
 		 245 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  31.21 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  32.32 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2475  TonB like protein  33.33 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  37.66 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1149  TonB family protein  35.63 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1020  TonB-like protein  32.31 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000273603  normal  0.0339055 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0876  TonB-like protein  32.31 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000261877  normal  0.0876537 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  34.21 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  34.81 
 
 		 1888 aa  58.2  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  29.91 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  33.73 
 
 		 270 aa  57  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  31.46 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  34.52 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0761  TonB family protein  37.7 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.988659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  35.14 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6109  TonB family protein  38.18 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  35.37 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  33.71 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  30.95 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  28.76 
 
 		 228 aa  52.4  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0886  hypothetical protein  32.73 
 
 		 2113 aa  52.8  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  37.7 
 
 		 245 aa  52.8  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  27.57 
 
 		 249 aa  51.6  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  31.5 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  31.5 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  33 
 
 		 2449 aa  51.2  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  30.15 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  29.21 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  30.15 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  33.73 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  25.71 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  30.41 
 
 		 193 aa  48.9  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  35.14 
 
 		 271 aa  48.5  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  33.73 
 
 		 289 aa  48.5  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1141  TonB family protein  30.56 
 
 		 234 aa  48.1  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  32.91 
 
 		 441 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  33.61 
 
 		 243 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  40.82 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0184  TonB family protein  31.34 
 
 		 267 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  33.61 
 
 		 243 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  27.27 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0456  TonB-like  27.91 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00460811  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  33.06 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  27.59 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  26.14 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1566  TonB family protein  30.83 
 
 		 251 aa  46.2  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0753  TonB family protein  28.57 
 
 		 230 aa  45.4  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.553846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  28.57 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  28.05 
 
 		 276 aa  44.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  26.24 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  27.89 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2086  TonB family protein  32.47 
 
 		 137 aa  44.3  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  29.41 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1440  TonB family protein  30.26 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  32.5 
 
 		 273 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  23.97 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  29.87 
 
 		 283 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  24.35 
 
 		 244 aa  43.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4696  TonB family protein  28.95 
 
 		 236 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3000  TonB protein  28.95 
 
 		 236 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  32.05 
 
 		 292 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  33.33 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  25.69 
 
 		 203 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  34.62 
 
 		 230 aa  41.6  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  28.92 
 
 		 275 aa  41.6  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  28.4 
 
 		 219 aa  41.6  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>