163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6109 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6109  TonB family protein  100 
 
 		 262 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  40.22 
 
 		 236 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  43 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  51.85 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1149  TonB family protein  45.26 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  43.02 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  40 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  40.7 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  40.7 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  40.7 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  40.7 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2223  TonB family protein  40.7 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  38.54 
 
 		 244 aa  72  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2277  TonB-like protein  42.05 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380607  normal  0.0262675 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  41.11 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  41.11 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  41.11 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  41.11 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  41.11 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1801  putative TonB protein  41.86 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613166  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1932  siderophore-mediated iron transport protein  41.86 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  41.11 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  38 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1963  TONB transmembrane protein  37.23 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  45.35 
 
 		 234 aa  68.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2475  TonB like protein  34.48 
 
 		 230 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  47.44 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2235  TonB, C-terminal  44.09 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361758  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  38.89 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  38.89 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  33.33 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  40.24 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  28.46 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2116  TonB family protein  41.49 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  41.76 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  41.03 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  40.24 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  41.76 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  41.76 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  38.16 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  29.02 
 
 		 212 aa  57  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  40.26 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  37.97 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  31.71 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  41.98 
 
 		 441 aa  55.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  37.97 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3773  TonB family protein  38.82 
 
 		 475 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.854647  normal  0.705204 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  35.44 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  37.5 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1807  TonB family protein  32.29 
 
 		 233 aa  53.1  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.390031  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  40 
 
 		 164 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1651  protein TonB  26.15 
 
 		 241 aa  52.8  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.350866  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  27.06 
 
 		 218 aa  52.4  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  40.79 
 
 		 202 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  32.98 
 
 		 244 aa  52.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  32.5 
 
 		 233 aa  52.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  35.8 
 
 		 244 aa  52  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  35.8 
 
 		 244 aa  52  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  31.65 
 
 		 217 aa  52  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  36.71 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  32.91 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  36.91 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  34.21 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  32.5 
 
 		 308 aa  50.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  32.17 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  32.93 
 
 		 280 aa  50.4  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  34.78 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  35.9 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  35.44 
 
 		 269 aa  50.4  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2441  TonB family protein  32.5 
 
 		 210 aa  50.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.124389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  37.8 
 
 		 285 aa  50.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1621  TonB-dependent receptor, putative, authentic frameshift  25.81 
 
 		 227 aa  50.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614853  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  37.66 
 
 		 258 aa  49.7  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  43.21 
 
 		 289 aa  49.3  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3718  periplasmic protein/ biopolymer transport  32 
 
 		 238 aa  49.3  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  31.17 
 
 		 290 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  28.93 
 
 		 300 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  41.03 
 
 		 271 aa  48.9  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  35.71 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  36.25 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  44.64 
 
 		 291 aa  48.1  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  44.64 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  35.71 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  40 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1906  TonB-like  30.86 
 
 		 334 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.338738  normal  0.207358 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1514  TonB family protein  30.1 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  36.25 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  31.76 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  31.76 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  31.76 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  36.78 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  35.63 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  31.52 
 
 		 277 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  36.14 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  38.98 
 
 		 334 aa  47  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2159  TonB family protein  29.73 
 
 		 277 aa  46.6  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  35.44 
 
 		 317 aa  47  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  34.33 
 
 		 371 aa  46.6  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0853  TonB-like  48.21 
 
 		 241 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  39.44 
 
 		 212 aa  46.2  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>