132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0522 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  100 
 
 
248 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  99.6 
 
 
248 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  98.79 
 
 
246 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  98.79 
 
 
246 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  98.79 
 
 
246 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1801  putative TonB protein  98.7 
 
 
229 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613166  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1932  siderophore-mediated iron transport protein  98.7 
 
 
229 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  89.52 
 
 
244 aa  337  9e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  49.8 
 
 
243 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  49.57 
 
 
226 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  45.82 
 
 
243 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  49.8 
 
 
243 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  49.8 
 
 
243 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2223  TonB family protein  50.43 
 
 
226 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534609  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  51.87 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  49.59 
 
 
244 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  49.6 
 
 
245 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  44.44 
 
 
245 aa  141  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2475  TonB like protein  54.95 
 
 
230 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  46.67 
 
 
223 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  48.68 
 
 
234 aa  77  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  48.72 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  36.17 
 
 
236 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  34.45 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  34.45 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1963  TONB transmembrane protein  42.31 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2277  TonB-like protein  41.03 
 
 
219 aa  68.6  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380607  normal  0.0262675 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  44 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1141  TonB family protein  40.74 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  37.66 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0753  TonB family protein  39.51 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.553846  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  34.18 
 
 
256 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0876  TonB-like protein  44.16 
 
 
275 aa  61.6  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000261877  normal  0.0876537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1020  TonB-like protein  44.16 
 
 
275 aa  61.6  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000273603  normal  0.0339055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1807  TonB family protein  36.36 
 
 
233 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.390031  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0815  TonB family protein  38.67 
 
 
224 aa  59.3  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  33.55 
 
 
219 aa  59.3  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2235  TonB, C-terminal  43.42 
 
 
218 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361758  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  41.03 
 
 
233 aa  58.5  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  41.03 
 
 
233 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  31.9 
 
 
237 aa  58.5  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1149  TonB family protein  35.56 
 
 
293 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  38.16 
 
 
233 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  36.84 
 
 
280 aa  57  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  31.71 
 
 
287 aa  57  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  37.18 
 
 
295 aa  56.2  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  37.18 
 
 
441 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3718  periplasmic protein/ biopolymer transport  45 
 
 
238 aa  55.8  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  40.54 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  35.06 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  36 
 
 
276 aa  54.3  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  35.06 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1792  TonB family protein  38.37 
 
 
218 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.433494 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  32 
 
 
288 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2116  TonB family protein  38.37 
 
 
218 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223061  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  36 
 
 
258 aa  53.5  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  33.33 
 
 
237 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  34.03 
 
 
274 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  38.67 
 
 
232 aa  53.5  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  38.67 
 
 
285 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  33.33 
 
 
249 aa  53.1  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  37.18 
 
 
234 aa  52.8  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  27.41 
 
 
249 aa  52.8  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  28.77 
 
 
212 aa  51.2  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  35.06 
 
 
285 aa  52  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6109  TonB family protein  39.36 
 
 
262 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  34.44 
 
 
255 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1621  TonB-dependent receptor, putative, authentic frameshift  26.26 
 
 
227 aa  50.8  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614853  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  29.87 
 
 
269 aa  50.1  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  25.96 
 
 
203 aa  49.7  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  40.82 
 
 
220 aa  50.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  37.33 
 
 
277 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1566  TonB family protein  32.89 
 
 
251 aa  49.3  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01076  TonB protein  37.8 
 
 
219 aa  48.9  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147824  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06243  TonB protein  37.8 
 
 
219 aa  48.9  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.442028  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3111  TonB, C-terminal  52 
 
 
174 aa  48.9  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  31.82 
 
 
193 aa  48.5  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  37.33 
 
 
273 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  30.99 
 
 
292 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  32.89 
 
 
368 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  27.16 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  35.8 
 
 
275 aa  48.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  34.31 
 
 
317 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  35.9 
 
 
208 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  36.84 
 
 
117 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  40 
 
 
243 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  38.57 
 
 
239 aa  47  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  36.56 
 
 
248 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  32.78 
 
 
292 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  40 
 
 
243 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10610  TonB protein  35.63 
 
 
280 aa  46.2  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.94051  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  40 
 
 
243 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  38.71 
 
 
1281 aa  46.6  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  31.97 
 
 
223 aa  46.2  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  36.84 
 
 
248 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4259  TonB family protein  41.18 
 
 
241 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  40 
 
 
244 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  35.06 
 
 
467 aa  45.8  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  32.89 
 
 
244 aa  45.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  26.62 
 
 
604 aa  45.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>