44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1651 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1651  protein TonB  100 
 
 
241 aa  491  9.999999999999999e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.350866  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1621  TonB-dependent receptor, putative, authentic frameshift  41.18 
 
 
227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614853  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0845  TonB  38.11 
 
 
227 aa  124  9e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1262  protein TonB  36.55 
 
 
235 aa  123  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0466  TonB domain protein  45.22 
 
 
217 aa  102  4e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1242  protein TonB  39.05 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.510655  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0392  ATP-binding protein  46.39 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.511226  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0716  TonB family protein  30.24 
 
 
212 aa  64.3  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  29.73 
 
 
292 aa  62.8  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  40.23 
 
 
261 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0878  TonB family protein  35.96 
 
 
248 aa  58.9  0.00000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2219  TonB family protein  36.05 
 
 
290 aa  58.9  0.00000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.479729  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0849  TonB, putative  24.81 
 
 
249 aa  58.5  0.00000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00146132  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0284  TonB family protein  31.96 
 
 
250 aa  55.5  0.0000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  44.62 
 
 
251 aa  53.1  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  33.71 
 
 
220 aa  52.8  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1467  TonB family protein  38.37 
 
 
265 aa  52.8  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132532  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  35.63 
 
 
244 aa  52  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  28.66 
 
 
242 aa  52  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  28.66 
 
 
242 aa  52  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  44.23 
 
 
239 aa  51.6  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2065  TonB family protein  28.07 
 
 
201 aa  51.6  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  27.42 
 
 
268 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  31.03 
 
 
289 aa  48.9  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1004  TonB-like  36.99 
 
 
239 aa  48.9  0.00008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1512  TonB family protein  46.94 
 
 
316 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4259  TonB family protein  40.28 
 
 
241 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  25.54 
 
 
219 aa  46.6  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  33.33 
 
 
268 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0644  TonB-like  33.78 
 
 
233 aa  45.4  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  38.24 
 
 
248 aa  45.4  0.0009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  36.54 
 
 
245 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  33.33 
 
 
268 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  27.97 
 
 
295 aa  44.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  33.33 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1845  TonB family protein  27.1 
 
 
268 aa  43.9  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3670  TonB1 protein  33.78 
 
 
274 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  40.82 
 
 
270 aa  43.5  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0965  TonB family protein  35.14 
 
 
283 aa  43.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  25.3 
 
 
212 aa  43.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4356  TonB-like protein  31.03 
 
 
212 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  29.17 
 
 
237 aa  42.4  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  35.06 
 
 
280 aa  42.4  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  31.82 
 
 
284 aa  42  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>