61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2159 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_2159  TonB family protein  100 
 
 		 277 aa  546  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  39.6 
 
 		 284 aa  85.5  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  28.93 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  31.37 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  30.77 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  34.44 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  33.98 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  23.13 
 
 		 268 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  26.67 
 
 		 268 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  31.82 
 
 		 250 aa  53.1  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0849  TonB, putative  24.1 
 
 		 249 aa  52.8  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00146132  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  31.52 
 
 		 266 aa  52.4  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  31.87 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  34.07 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  24.1 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  31.87 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  27.08 
 
 		 256 aa  52  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0708  TonB family protein  29.47 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2906  TonB-like  29.89 
 
 		 235 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155829  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  31.87 
 
 		 243 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  24.66 
 
 		 292 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  30.19 
 
 		 228 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  28.57 
 
 		 251 aa  50.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  36.36 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  26.06 
 
 		 242 aa  50.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  32.61 
 
 		 244 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  26.06 
 
 		 242 aa  50.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0392  ATP-binding protein  38.33 
 
 		 257 aa  50.1  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.511226  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0914  TonB family protein  27.88 
 
 		 174 aa  50.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  27.47 
 
 		 285 aa  48.9  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  28.75 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0644  TonB-like  23.3 
 
 		 233 aa  48.1  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  30.77 
 
 		 239 aa  47.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  29.24 
 
 		 324 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  22.49 
 
 		 938 aa  47  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  26.37 
 
 		 292 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1643  TonB family protein  30 
 
 		 337 aa  46.2  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0339167  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  41.07 
 
 		 258 aa  45.8  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  37.5 
 
 		 164 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  33.93 
 
 		 280 aa  45.8  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  27.47 
 
 		 286 aa  45.4  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  37.5 
 
 		 202 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  27.78 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3965  TonB family protein  27.08 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1621  TonB-dependent receptor, putative, authentic frameshift  25.43 
 
 		 227 aa  45.4  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614853  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  32.97 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  30.26 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  24.09 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  31.11 
 
 		 411 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  32.97 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  32.97 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  27.69 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3288  TonB family protein  26.97 
 
 		 194 aa  43.9  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.634309  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1566  TonB family protein  25.71 
 
 		 251 aa  43.9  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  32.31 
 
 		 317 aa  43.5  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4259  TonB family protein  32.65 
 
 		 241 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10610  TonB protein  31.25 
 
 		 280 aa  43.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.94051  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0845  TonB  30.23 
 
 		 227 aa  43.1  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1262  protein TonB  26.36 
 
 		 235 aa  42.7  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  24.34 
 
 		 264 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1512  TonB family protein  33.33 
 
 		 316 aa  42  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>